我是一名SAS程序员

Adrian2Hope 发表于 2017-8-14 10:23
To jeffkykong: 看你问题，很高级，像是预测和时间序列模型，是经济方面吗?鄙人也不懂这个，也没有考过这个 ...

嗯，好的，谢谢您，可能是我的代码不够精确，对GAM 的sas 程序理解的不够，运用的不熟练，我再询问一下群里其他老师！

终于把某个项目交掉了，但过段时间后，就会来很多comments，然后programmer就对着这些要求来改自己的程序以及相关的文件，这里说一点点TFLs comments。
1 某张table或listing中header改变，或者某一行的label改变，但值是不变的。比如一段语句中首字母大写呀，把start date/day变成date/day of start，连接符前后要加空格等等，反正花样多多，人家说怎么改，就怎么改。其实大部分时候，这种更新是有依据有意义和有必要的。它能让这些TFLs更标准化，更好理解，更符合这个study(protocol, CRF..)，这在程序里只需要做一些wording工作就行。所以，熟悉和了解一些general的comments是很必要的。
2 对于增加某行或某列，那就要再写code。如果这个新加的变量更合适放在ADaM中的话，那这一段程序可以放在ADaM中写。另外，对于ADaM data set，因为是要求ready to analysis，窃以为，把在TFLs中的programming放到ADaM中更好些，具体原因如下：
a, 除了一些ADaM model要求的基础变量之外，ADaM数据集是可以按user-defined的要求生成一些变量的，包括命名，computation rules。当然了，也要follow ADaM IG里面的general standard。
b, ADaM数据集本来是为TFLs服务的，它的生成是为了更方便的出TFLs。试想，现在要连接start date, start day, end date, end day, duration形成一个变量在listing输出，也就是说把5个变量合成一个，再者，这个信息在3个listing中都要出现。如果都在listing中programming的话，那是不是要把这段程序写3遍。更多时候，要按某种format科学合理的呈现data，那这程序还挺长的，这不就增加了工作量嘛。如果在以后要对这列进行算法更新，这就挺麻烦的，而放在ADaM中，则只用update一次，而且也好找好改。
c. Listing到底要不要写完整的程序qc且不论。如果original and validation都在TFLs中programming的话，因为用的变量属性不一样，程序中的处理也不一样，这就增加compare的时间了。这一个变量的qc，放在ADaM中处理，完了之后，TFLs用相同的变量，也就省事得多。
所以，我觉得经的经过SDTM标准化数据之后，ADaM是个很重要的步骤，做得好了，承上启下，对整个study的高效，快速，准确的完成意义重大。个人意见而已，仅供学习讨论。
3 下面是data display方面。比如像CM这种经常date不是很清楚的，那在listing中如何呈现呢?。首先，listing中呈现的都是"raw data"。在ADaM中，像--STDTC,--ENDTC,--DTC,这都是直接从SDTM中拿过来的，而SDTM也是从raw data里拿的。那在listing应该display这样的变量。如果是2013-06,或者2000，这种日期时间数据不完整的，这就是"raw data"。而ASTDT是经过某种rule算出来的，更多的是分析所用。如果某一条CM的记录只有start date，没有end date，因而也没有duration,那要像上面要求怎么连呢?有的要求不管后面有没有数据，也要用类似"/"来标注，以说明这个记录没有end date，比如2013-06/，也有表示成2013-06,把后面放空。再比如像某列要显示yes or no，如果是yes,再在后面写原因。可以显示成Yes/Reasons 或者No，如果结果为yes但原因缺失，仍然显示成"Yes/"。我个人prefer后者，好像看起来有点多余，但却很清晰地表达了某个信息。
4 有些title/footnote，analysis population 需要更新。在title中，可能需要加入选定的语句来更加明确地表达出这个表的内容。footnote可能需要加入更详细一点的footnote来解释TFLs中用到的省略词语，比如severe AE中，1 = Results in Death，Baseline is defined the last non-missing record before first dose. Study day is defined as the day relative to the first dose等等。表中的[a], [b]...要和下面的footnote一一对应。同一个footnote可能存在很多个TFLs中。比如listing中要出现的subject/age/sex/race，在footnote中就要说明这里面的值代表什么意思，比如F = Female, W = White之类。
5 针对某些table的update,也许改动比较大了。比如开始给出的shell里面，只要summarize某个SOC/PT之下的subjects and percent，而实际上一般都是SOC一个汇总，下面每一条PT也汇总,如果这个PT下面再有Severe Grade或者Relationship to study drug之类的分组，如果可以的话，可以在程序里一层一层地把它都求出来，要哪些内容再输出哪些内容。因为有些draft mock-up没有finalized，后面可以需要加入更多的内容，还不如刚开始写程序的时候，就考虑得深远一点。
6 像某个table后面，一般都有某个listing与之对应，这样可以便于cross check。比如在table中算得的年龄最小值为18，而在后面的listing中，从一条条的patient看过去，年龄都是大于20的。那这就前后矛盾了。前面的disposition表显示safety population（如果这个flag是定义为服用过试验用药的人）只有10个人，但其他表的header中的大N总和并不等于10，这就有问题。原因可能是这个人dose date不为空，但arm=not assigned，也就是data中，这个人有用药记录，但没有给他assignment treatment。像这种data issue，有的时候是data本身的issue，另外就是程序中可能出现了错误。
哆嗦了这么多，不知道听烦了没有，这并不是一个系统性的总结，只是想到哪里就说到哪里。如果有时间，我想以后再专门就自己想到的一些general rules写出来，这样比较有完整和系统些，也好和大家参与讨论。

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不好用。

谢谢分享啦

谢谢分享啦

AZ 的study ，友情提醒一下，如果把公司的结果截图发出来，一般来说都是违反公司规则的。就算拿出来当例子，也要把关键信息隐藏一下。

楼上朋友提醒的是，这是不对的，已做处理。

为什么这个图片怎么删都删不掉！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！

这种体验非常不好，不想再发了都！