argparse库怎么设置参数

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有一个python脚本，不用argparse设置参数运行python test.py会产生一个这样的数据框，此时输入数据是脚本里固定的

start  end strand
60  235      W
235  418      W
54  500      W
-1   43      C
79  262      C
262  437      C
459  500      C


现在想要在命令行添加参数，比如运行的时候使用python test.py --input data.txt --output result.csv -chr 2 指定输入输出文件，并且结果中增加一列

start  end strand  chr
60  235      W    chr2
235  418      W   chr2
54  500      W    chr2
-1   43      C    chr2
79  262      C    chr2
262  437      C    chr2
459  500      C    chr2


我知道dataframe['chr'] = 'chr2'可以添加列，但是我要运行不同的数据，所以想要在命令行添加各种参数
请问一下脚本里应该添加什么内容？

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关键词：ARS GPA Dataframe python Start

May be you can find this will do some helpness: https://docs.python.org/3/library/argparse.html

使用 sys库就可以, 请参考一下代码

1. import sys
   
2. print ("脚本名：", sys.argv[0])
   
3. for i in range(1, len(sys.argv)):
   
4.     print ("参数", i, sys.argv[i])

复制代码

chr的列写死的情况下。可以这么做：

1. from __future__ import print_function
   
2. import argparse
   
3. import pandas as pd
   
4. 
   
5. data = pd.DataFrame([[60, 235, 'W'], [235, 418, 'W'], [54, 500, 'W'], [-1, 43, 'C'], [79, 262, 'C'],
   
6.                      [262, 437, 'C'], [459, 500, 'C']], columns=['start', 'end', 'strand'])
   
7. 
   
8. parser = argparse.ArgumentParser(description='test')
   
9. 
   
10. parser.add_argument('--input', metavar='data.txt', help='input file - data.txt')
    
11. parser.add_argument('--output', metavar='result.csv', help='output file - result.csv')
    
12. parser.add_argument('--chr', metavar='2', help='chr value - 2')
    
13. 
    
14. config = parser.parse_args()
    
15. config_dict = config.__dict__
    
16. chr_v = config_dict.get('chr')
    
17. data['chr'] = chr_v
    
18. 
    
19. print(data)

复制代码

使用 python test.py --input data.txt --output result.csv --chr 2