楼主: 码农npc
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  1. #新建clonal.subclonal,存储56个重要基因的克隆、亚克隆、野生型数目
  2. clonal.subclonal <- matrix(NA, nrow = length(gene), ncol = 3, dimnames= list(gene, c("Clonal", "Subclonal", "WT")))
  3. for(i in gene)
  4. {
  5. clonal.subclonal[i,] <- table(clonal.table[,i])
  6. }
复制代码
显示这样的错误提醒
  1. Warning message:
  2. In strsplit(code, "\n", fixed = TRUE) :
  3.   input string 1 is invalid in this locale
  4. Error in clonal.subclonal[i, ] <- table(clonal.table[, i]) :
  5.   number of items to replace is not a multiple of replacement length
复制代码
然后出来了一半的结果
7G3JP)XM([608{@85$Z%HID.png
也就是说运行到一半就结束了,我观察了数据发现,可能是SAMRCD1这个基因没有亚克隆的状态,但是这个问题应该怎么解决
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关键词:统计 r循环 分类

沙发
cheetahfly 在职认证  发表于 2018-12-10 21:49:50 |只看作者 |坛友微信交流群
不要用matrix存放结果,用一个空的list存放,
然后用do.call(dplyr::bind_rows, myListResult)
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藤椅
码农npc 发表于 2018-12-11 20:07:28 |只看作者 |坛友微信交流群
cheetahfly 发表于 2018-12-10 21:49
不要用matrix存放结果,用一个空的list存放,
然后用do.call(dplyr::bind_rows, myListResult)
已经找到如何解决了,

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板凳
dx19961118 发表于 2018-12-19 10:42:03 |只看作者 |坛友微信交流群
码农npc 发表于 2018-12-11 20:07
已经找到如何解决了,
想知道怎么解决的,谢谢!
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码农npc 发表于 2018-12-21 20:35:47 |只看作者 |坛友微信交流群
dx19961118 发表于 2018-12-19 10:42
想知道怎么解决的,谢谢!
这里没有设定level,如果有哪一类为0的话,只会返回两个结果,对应不了输出

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