搜索
人大经济论坛 附件下载

附件下载

所在主题:
文件名:  原始CSV数据.rar
资料下载链接地址: https://bbs.pinggu.org/a-2151097.html
本附件包括:
  • env.csv
  • spe.csv
附件大小:
各位老师,请教个问题:
使用dbstats包中的dblm函数做基于距离的线性模型,spe为物种数据,env为环境因子数据,代码如下:
library(vegan)
library(dbstats)
> spe=read.csv("spe.csv",row.names=1)
> env=read.csv("env.csv",row.names=1)
> spe=log1p(spe)
> env=decostand(env,"standardize")
> spe.dist=vegdist(spe,"bray")
> spe.dblm=dblm(spe.dist~env,data=env)

报错:Error in model.frame.default(formula = formula, data = data, drop.unused.levels = TRUE) : 参数'env'的种类(list)不对




使用BiodiversityR包中的CAPdiscrim函数做典范主坐标排序,spe为物种数据,env为环境因子数据,代码如下:
library(vegan)
library(BiodiversityR)
> spe=read.csv("spe.csv",row.names=1)
> env=read.csv("env.csv",row.names=1)
> spe=log1p(spe)
> env=decostand(env,"standardize")

环境因子以env表示:
> spe.cap=CAPdiscrim(spe~env,data=env,dist="bray",axes=2,m=0,permutations=1000)
报错:Error in `[.data.frame`(y, , group) : undefined columns selected


环境因子以各自名字表示:
>spe.cap=CAPdiscrim(spe~X1+X2+X3+X4+X5+X6+X7+X8+X9+X10+X11+X12+X13+X14,data=env,dist="bray",axes=2,m=0,permutations=1000)
报错:Error in eval(predvars, data, env) : 数值'envir'参数的长度不是一

跪求大神帮忙解答,万分感谢!附原始CSV数据。



    熟悉论坛请点击新手指南
下载说明
1、论坛支持迅雷和网际快车等p2p多线程软件下载,请在上面选择下载通道单击右健下载即可。
2、论坛会定期自动批量更新下载地址,所以请不要浪费时间盗链论坛资源,盗链地址会很快失效。
3、本站为非盈利性质的学术交流网站,鼓励和保护原创作品,拒绝未经版权人许可的上传行为。本站如接到版权人发出的合格侵权通知,将积极的采取必要措施;同时,本站也将在技术手段和能力范围内,履行版权保护的注意义务。
(如有侵权,欢迎举报)
二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

GMT+8, 2026-2-1 20:11