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数据格式如下:
1 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10029 TACAGACTGTGG CTCTCCTATAGC chr2 184106244 184106312 2 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10099 TGATACCGGACA GTGCCTCATCTA chr3 139790591 139790643 3 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10099 TGATACCGGACA GTGCCTCATCTA chr3 139790643 139790591 4 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10169 CTTCCATAGGCA AGAGTTCACGGA chr6 26713971 26713996 5 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10169 CTTCCATAGGCA AGAGTTCACGGA chr6 26713996 26713971 6 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10240 TAGACGTAGACG TCAAGGAGAACC chr14 37255539 37255588 7 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10240 TCAAGGAGAACC TAGACGTAGACG chr14 37255588 37255539 8 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:15795 ACGACACTGCTA CTCTCCTATAGC chr14 96799778 96799778 9 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10029 CTCTCCTATAGC TACAGACTGTGG chr2 184106312 184106244 (第一列的序号是自己加的,原文件中没有) 比如第6、7行,他们的第2、3列顺序相反,第5、6列顺序也刚好相反,其余的字段内容相同 以及第1、9行,也是第2、3列顺序相反,第5、6列顺序也刚好相反,其余的字段内容相同 现在想要把这种成对的两行输出到一个文件,例如上述数据的输出结果应该是: E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10029 TACAGACTGTGG CTCTCCTATAGC chr2 184106244 184106312 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10029 CTCTCCTATAGC TACAGACTGTGG chr2 184106312 184106244 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10240 TAGACGTAGACG TCAAGGAGAACC chr14 37255539 37255588 E00548:177:HKH53CCXY:4:1101:10003:10240 TCAAGGAGAACC TAGACGTAGACG chr14 37255588 37255539 数据比较大,有没有什么简单一点的方法快速找到想要的数据对? |
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