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所在主题：
文件名:  for.match.rar
资料下载链接地址: https://bbs.pinggu.org/a-3130588.html
本附件包括：
  • for.match.R
  • GSE102286_series_matrix.txt
  • GSE13937_series_matrix.txt
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大家好，遇到for循环问题，求朋友们指点，多谢！目的：查找向量miR.signature中的元素 是否出现在数据集GSE13937、GSE102286的 'X.ID_REF.'列（第1列）中

问题：
1.第2段的for循环不知是否得到预期结果、第3段的for循环确定没得到预期结果：GSE102286[, 'X.ID_REF.']里面是有'hsa-mir-605', 'hsa-mir‐629'的（能匹配上），在第4段代码中也能得到证实，为什么用第3段的for循环得不出结果？
2.我的代码里，对两个数据集GSE13937、GSE102286是各自运行一遍代码，能否也写个循环，一步搞定？这样的话，两个数据集GSE13937、GSE102286需要先合并成list吗？
3.结果是否应该保存在list里面，这样能够看到具体哪个元素在哪个数据集的第1列中匹配上了？
4.第1段的for循环，是否也能嵌套在一起？

数据已上传至网盘
链接: https://pan.baidu.com/s/1wZH0c3SIQmoLON_qtHjqvg 提取码: mnjj
再次感谢大家！


  1. miR.signature <- c('hsa-mir-3607', 'hsa-mir-3677', 'hsa-mir-4661', 'hsa-mir-548v', 'hsa-mir-605', 'hsa-mir‐629')
  2. miR.pattern <- vector("character", length(miR.signature))
  3. for (i in seq_along(miR.signature)) {
  4. miR.pattern[i] <- paste(miR.signature[i], '.*', sep = "")
  5. }
  6. miR.pattern


  9. GSE13937 <- read.table(file="./GSE13937_series_matrix.txt",
  10. header = T, sep = "\t", quote = "", fill = T,
  11. comment.char = "!")
  12. for (j in seq_along(miR.pattern)) {print(grep('miR.pattern[j]', GSE13937[, 'X.ID_REF.'], value = T, ignore.case = T))
  13. }



  17. GSE102286 <- read.table(file="./GSE102286_series_matrix.txt",
  18. header = T, sep = "\t", quote = "", fill = T,
  19. comment.char = "!")
  20. View(GSE102286[, 1])
  21. for (k in seq_along(miR.pattern)) {print(grep('miR.pattern[k]', GSE102286[, 'X.ID_REF.'], value = T, ignore.case = T)) # ignore.case = T表示忽略大小写
  22. }


  25. grep('hsa-mir-605.*', GSE102286[, 'X.ID_REF.'], value = T, ignore.case = T)
  26. print(grep('hsa-mir-605.*', GSE102286[, 'X.ID_REF.'], value = T, ignore.case = T))
  27. print(grep('hsa-mir-629.*', GSE102286[, 'X.ID_REF.'], value = T, ignore.case = T))
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