学校现有22个省部级重点学科，“地质资源与地质工程”、“石油与天然气工程”2个一级学科被遴选为湖北省优势学科，“地球化学”、“作物栽培学与耕作学”2个二级学科被遴选为湖北省特色学科，13个重点学科设有“楚天学者计划”特聘教授岗位。现有26个国家、省部级重点实验室、工程技术研究中心和实验中心，其中油气资源与勘探技术实验室为教育部重点实验室，淡水鱼类种质资源与生物技术实验室为农业部重点开放实验室，湿地农业工程研究中心为教育部工程研究中心，电工电子实验教学中心为国家级实验教学示范中心，2个湖北省重点实验室，1个湖北省工程技术研究中心，6个中石油集团公司重点实验室，2个湖北省共性技术研究中心，2个省级人文社科研究基地，9个湖北省实验教学示范中心；有23个中央与地方共建实验室。在2002～2004年全国一级学科评估中，学校“地质资源与地质工程”、“石油与天然气工程”2个学科在全国同类学科排名中位列前10名。学校在石油科学与技术、涝渍灾害与湿地农业、荆楚文化研究等领域具有鲜明特色。