R语言复刻一张图

网上见的这张图，请问：
1、如何用R代码实现类似效果？
2、不需要原图复刻，能实现20个标签即可。

稍微看了一下，图应该是来自于

https://www.evogeneao.com/en

个人觉得这个图应该不是用什么标准化软件生成的，而且网站上提供的实际上是一个可交互的图。
数据的结构没办法知道，如果你能找到数据的来源，可以再进一步研究。
如果你要生成类似的效果，我稍微查看了一下，有一个ggtree的包可以生成类似的图，但是是360度而不是这个180度。比如你可以参考

https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ggtree.html

一些例子可以看看

https://www.molecularecologist.com/2017/02/08/phylogenetic-trees-in-r-using-ggtree/

https://yulab-smu.top/treedata-book/index.html

owenqi 发表于 2021-11-5 04:18
稍微看了一下，图应该是来自于

个人觉得这个图应该不是用什么标准化软件生成的，而且网站上提供的实际上 ...

O老师好
久违。系统发育树的包画出来的总差那么点意思，比如时间分割线、进化枝布局.
ape、tidytree、ggtree是一种方案，可以采用layout = "fan"解决布局问题，但是画出来的比较“硬”.

一个想法，系统发育树画出来后，添加时间分割线，然后调整为coord_polar()，可能实现类似的效果，哪天时间充裕试试.
一个猜想，用d3不知道能不能实现.

数据的结构我大概知道一些，用phylo类型数据应该可以。

再等等看其他老师有没有指点，没有的话下周结贴.

llb_321 发表于 2021-11-5 10:18
O老师好
久违。系统发育树的包画出来的总差那么点意思，比如时间分割线、进化枝布局.
ape、tid ...

这东西我是纯小白，也直到你回复了我才知道这东西叫作“系统发育树”。
所以对具体的比如数据结构，常用的图类型都不了解。我也就是根据你发的这个图找的，所以没办法提供什么有实质意义的帮助。