没有分支界限的系统发育：缩短短的，修剪短的 深

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摘要翻译：
我们提出了一种新的系统发生重建算法，与以往大多数严格的推理技术不同，它不依赖于关于分支长度或树深度的假设。该算法返回一个保证包含所有边的森林，这些边是：1）足够长和2）足够靠近树叶，恢复到真树的多少取决于提供的序列长度，该算法是基于距离的，在多项式时间内运行。
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英文标题：
《Phylogenies without Branch Bounds: Contracting the Short, Pruning the
  Deep》
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作者：
Constantinos Daskalakis, Elchanan Mossel, Sebastien Roch
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最新提交年份：
2009
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分类信息：

一级分类：Quantitative Biology        数量生物学
二级分类：Populations and Evolution        种群与进化
分类描述：Population dynamics, spatio-temporal and epidemiological models, dynamic speciation, co-evolution, biodiversity, foodwebs, aging; molecular evolution and phylogeny; directed evolution; origin of life
种群动力学；时空和流行病学模型；动态物种形成；协同进化；生物多样性；食物网；老龄化；分子进化和系统发育；定向进化；生命起源
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一级分类：Computer Science        计算机科学
二级分类：Computational Engineering, Finance, and Science        计算工程、金融和科学
分类描述：Covers applications of computer science to the mathematical modeling of complex systems in the fields of science, engineering, and finance. Papers here are interdisciplinary and applications-oriented, focusing on techniques and tools that enable challenging computational simulations to be performed, for which the use of supercomputers or distributed computing platforms is often required. Includes material in ACM Subject Classes J.2, J.3, and J.4 (economics).
涵盖了计算机科学在科学、工程和金融领域复杂系统的数学建模中的应用。这里的论文是跨学科和面向应用的，集中在技术和工具，使挑战性的计算模拟能够执行，其中往往需要使用超级计算机或分布式计算平台。包括ACM学科课程J.2、J.3和J.4（经济学）中的材料。
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一级分类：Computer Science        计算机科学
二级分类：Data Structures and Algorithms        数据结构与算法
分类描述：Covers data structures and analysis of algorithms. Roughly includes material in ACM Subject Classes E.1, E.2, F.2.1, and F.2.2.
涵盖数据结构和算法分析。大致包括ACM学科类E.1、E.2、F.2.1和F.2.2中的材料。
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一级分类：Mathematics        数学
二级分类：Probability        概率
分类描述：Theory and applications of probability and stochastic processes: e.g. central limit theorems, large deviations, stochastic differential equations, models from statistical mechanics, queuing theory
概率论与随机过程的理论与应用：例如中心极限定理，大偏差，随机微分方程，统计力学模型，排队论
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一级分类：Mathematics        数学
二级分类：Statistics Theory        统计理论
分类描述：Applied, computational and theoretical statistics: e.g. statistical inference, regression, time series, multivariate analysis, data analysis, Markov chain Monte Carlo, design of experiments, case studies
应用统计、计算统计和理论统计：例如统计推断、回归、时间序列、多元分析、数据分析、马尔可夫链蒙特卡罗、实验设计、案例研究
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一级分类：Statistics        统计学
二级分类：Statistics Theory        统计理论
分类描述：stat.TH is an alias for math.ST. Asymptotics, Bayesian Inference, Decision Theory, Estimation, Foundations, Inference, Testing.
Stat.Th是Math.St的别名。渐近，贝叶斯推论，决策理论，估计，基础，推论，检验。
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英文摘要：
  We introduce a new phylogenetic reconstruction algorithm which, unlike most previous rigorous inference techniques, does not rely on assumptions regarding the branch lengths or the depth of the tree. The algorithm returns a forest which is guaranteed to contain all edges that are: 1) sufficiently long and 2) sufficiently close to the leaves. How much of the true tree is recovered depends on the sequence length provided. The algorithm is distance-based and runs in polynomial time.
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PDF链接：
https://arxiv.org/pdf/801.419

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关键词：短短的 Applications Multivariate Mathematical Construction 假设 Branch sufficiently 算法 introduce