长期低氧胁迫下红鳍东方鲀鳔的转录组分析

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1 论文标题：长期低氧胁迫下红鳍东方鲀鳔的转录组分析

2 作者信息：陆 芸, 李 岩*, 魏仁杰：大连海洋大学水产与生命学院，辽宁 大连；辽宁省河鲀良种繁育及健康养殖重点实验室，辽宁 大连；尚凤芹：辽宁省河鲀良种繁育及健康养殖重点实验室，辽宁 大连；大连海洋大学海洋科技与环境学院，辽宁 大连；韩 冰, 刘 洋#：大连海洋大学水产与生命学院，辽宁 大连；王秀利：辽宁省河鲀良种繁育及健康养殖重点实验室，辽宁 大连

3 出处和链接：陆芸, 李岩, 尚凤芹, 韩冰, 魏仁杰, 王秀利, 刘洋. 长期低氧胁迫下红鳍东方鲀鳔的转录组分析[J]. 海洋科学前沿, 2023, 10(1): 5-21. https://doi.org/10.12677/AMS.2023.101002

4 摘要：水中的溶解氧(Dissolved Oxygen, DO)水平影响着鱼类的生存、繁殖、生长和发育。缺氧会对水产养殖业的发展，生物多样性以及生态系统的功能产生影响。因此，本研究以红鳍东方鲀(Takifugu ru-bripes)为研究对象，对常氧(7.5 ± 0.5 mg/L)与低氧(2.5 ± 0.5 mg/L，10天)环境下的红鳍东方鲀的鳔组织进行了转录组测序分析，以探究其应对低氧胁迫时的分子调控机制。随之，筛选出差异表达基因并对其进行生物信息学分析。同时，进一步采用qRT-PCR进行了验证。结果显示，在红鳍东方鲀的鳔组织中共鉴定到了536个差异基因，包括493个上调基因和43个下调基因。KEGG富集结果表明，钙信号传导途径，环磷酸腺苷(cAMP)通路，胰岛素分泌三个信号通路通过调整机体内离子转运，在机体适应低氧环境、维持细胞存活中发挥了重要作用。此外，GSEA富集分析表明，红鳍东方鲀还通过下调DNA复制，细胞周期等耗能的生物过程来抑制细胞正常分裂和生长，从而减少低氧环境中的能量消耗。最后，我们随机挑选了转录组数据中的6个基因进行qRT-PCR验证，结果与转录组数据分析相一致，证实了转录组测序结果的可靠性。本研究结果不仅丰富了红鳍东方鲀响应低氧胁迫的分子调控机制，同时为探究鱼类的低氧适应机制提供了理论依据。

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