反转座子预测

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3、LTR_STRUC
简介：LTR_STRUC
是由美国乔治亚大学的
Eugene
和John
于2002
年开发的
LTR-
反转座子预测软件。它不同于其它基于序列同源比对的方法，而是根据转座子的结构特征，如复制时必需的
PBS和PPT位点,以及LTR末端的TG和CA位点，从
DNA序列上预测转座子的位置和结构。
下载：该软件是免费软件，目前只有
Windows
版，运行时至少需要
512M
内存。可以从以下网址
。下载：http://www.genetics.uga.edu/retrolab/data/LTR_Struc.html
当前版本：
version 1.1
使用：该软件的使用可分为以下几步：
（1）在C盘根目录下创建一个名为“
LTR_STRUC
”的目录
；（2）将下载的程序文件“
LTR_STRUC_1_1.exe
”，以及辅助文件“
five_p_end.txt
”，“pbs.txt
”，“rt.txt
”，和“
flist.txt
”放置于该目录下
；（3）在C:\ LTR_STRUC
下创建一个名为“
input
”的目录，并将需要操作的序列文件（
Fasta ...

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关键词：GENETICS Genetic Windows Version Eugene