基于基因表达和甲基化分析识别肿瘤预后因子联合分析：课程数据+代码

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|+生存             106.0 MB
| | 说明文档.docx              15.2 KB
| | 基因甲基化谱与生存数据合并+生存分析.R              1.6 KB
| | 差异表达差异甲基化取交集+甲基化谱整理.R              1.4 KB
| | 差异表达差异甲基化取交集+mRNA表达谱整理.R              1.3 KB
| | 表达和甲基化生存相关的基因取交集+TCGA数据整理.R              2.2 KB
| | TCGA生存分析.R              1.2 KB
| | TCGA_microarray.txt              104.0 MB
| | TCGA_GBM_Clinical.txt              18.6 KB
| | TCGA_cox_gene_0.05.txt              191 Byte
| | TCGA_clinical_gene.txt              1.5 MB
| | mRNA与生存数据合并+生存分析.R              1.6 KB
| | mRNA_diff_gene.txt              358.0 KB
| | mRNA_cox_gene_0.05.txt              10.7 KB
| | methy_diff_gene.txt              215.0 KB
| | methy_cox_gene_0.05.txt              11.7 KB
| | diff_mRNA.txt              11.2 KB
| | diff_methylation.txt              30.8 KB
| | CGGA_mRNA_micro_OS.txt              3.9 KB
| | CGGA_methylation_OS.txt              1.1 KB
|+关键基因验证-DLL3             751.0 MB
| | 说明文档.txt              523 Byte
| | TCGA-seq.txt              24.4 MB
| | TCGA_seq_OS_DLL3.txt              6.5 KB
| | TCGA_seq_log2.txt              57.2 MB
| | TCGA_microarray.txt              104.0 MB
| | TCGA_micro_OS_DLL3.txt              22.5 KB
| | TCGA_GBM_Clinical.txt              18.6 KB
| | TCGA_array_log2.txt              105.0 MB
| | GSE16011_gene_expfile.txt              65.1 MB
| | GSE16011_family.soft              102.0 MB
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| | GPL8542_ID.txt              267.0 KB
| | Entranz_genesymble.txt              224.0 KB
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| | CGGA_micro_OS_DLL3.txt              4.9 KB
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| | CCGA_micro_OS_DLL3_2.txt              14.0 KB
| |+箱式图              133.0 KB
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| | | CGGA_array_DLL3_IDH1_mut.pdf               10.6 KB
| | | CGGA_array_DLL3_grade.pdf               22.4 KB
| |+生存曲线              18.9 KB
| | | TCGA_array.pdf               8.3 KB
| | | CGGA_seq.pdf               5.4 KB
| | | CGGA_array.pdf               5.2 KB
| |+程序              29.9 KB
| | | 热图.R               1.5 KB
| | | TCGA_array_生存_DLL3-6.R               1.7 KB
| | | GSE探针名匹配基因名.R               1.0 KB
| | | GSE16011_clinical数据处理.R               1.7 KB
| | | GSE16011_clinical_DLL3_grade.R               597 Byte
| | | DLL3与TCGA_array生存数据合并-5.R               1.3 KB
| | | DLL3基因与GSE16011数据合并.R               1.3 KB
| | | DLL3基因与CGGA_array生存数据合并-1.R               989 Byte
| | | DLL3_ROC_TCGA_array.R               3.0 KB
| | | DLL3_ROC_CGGA_seq.R               3.3 KB
| | | DLL3_ROC_CGGA_array.R               3.3 KB
| | | CGGA_seq数据处理+DLL3基因与生存数据合并-3.R               1.3 KB
| | | CGGA_seq_生存_DLL3-4.R               1.7 KB
| | | CGGA_seq_DLL3_subtype.R               478 Byte
| | | CGGA_seq_DLL3_IDH1_mut+subtype.R               494 Byte
| | | CGGA_seq_DLL3_IDH1_mut.R               470 Byte
| | | CGGA_seq_DLL3_BOX.R               1.5 KB
| | | CGGA_microarray_生存_DLL3-2.R               1.2 KB
| | | CGGA_array_DLL3_subtype+mut.R               564 Byte
| | | CGGA_array_DLL3_subtype.R               488 Byte
| | | CGGA_array_DLL3_IDH1_mut.R               478 Byte
| | | CGGA_array_DLL3_BOX.R               1.7 KB
| |+ROC              21.6 KB
| | | CGGA_seq_DLL3_5.pdf               5.4 KB
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| | | CGGA_array_DLL3_5.pdf               5.4 KB
| | | CGGA_array_DLL3_3.pdf               5.4 KB
| |+GSE16011              225.0 MB
| |  说明文档.txt               523 Byte
| |  表达谱标准化.R               1.7 KB
| |  GSE16011_series_matrix.txt               56.6 MB
| |  GSE16011_gene_expfile.txt               65.1 MB
| |  GSE16011_family.soft               102.0 MB
| |  GPL8542_ID.txt               267.0 KB
| |  Entranz_genesymble.txt               224.0 KB
|+差异甲基化分析             110.0 MB
| | 说明文档.docx              14.0 KB
| | 生存样本的甲基化谱27-10.R              2.2 KB
| | 合并不同甲基化的基因甲基化谱_均值.R              725 Byte
| | mathylation_result.xlsx              6.0 MB
| | mad.R              601 Byte
| | CGGA_methylation_uni_result.txt              9.4 MB
| | CGGA_methylation_result.txt              18.2 MB
| | CGGA_methylation_OS_3.txt              345 Byte
| | CGGA_methylation_OS_1.txt              804 Byte
| | CGGA_methylation_nolog_result.txt              10.5 MB
| | CGGA_methylation.txt              41.7 MB
| | CGGA_methy_turn.txt              9.4 MB
| | CGGA_mathylation_mad.xlsx              5.5 MB
| | CGGA_mathylation_mad.txt              9.6 MB
|+TCGA原始数据             105.0 MB
| | TCGA_microarray.txt              104.0 MB
| | GBM Clinical BCR XML.merge.txt              935.0 KB
|+mRNA差异表达分析             217.0 MB
| | 提取生存相关样本基因表达谱65-33.R              1.2 KB
| | 说明文档.docx              15.9 KB
| | 合并不同探针的基因表达值_均值.R              552 Byte
| | mRNA_result.xlsx              13.0 MB
| | mad.R              537 Byte
| | CGGA_mRNA_turn.txt              21.3 MB
| | CGGA_mRNA_microarray_OS_3.txt              1.4 KB
| | CGGA_mRNA_microarray_OS_1.txt              2.6 KB
| | CGGA_mRNA_microarray_exp_result.txt              21.4 MB
| | CGGA_mRNA_microarray_exp.txt              30.9 MB
| | CGGA_mRNA_microarray.txt              93.9 MB
| | CGGA_mRNA_mad.xlsx              14.8 MB
| | CGGA_mRNA_mad.txt              21.6 MB
|+GSE16011原始数据             57.0 MB
| | GSE16011_series_matrix.txt              57.0 MB
|+CGGA原始数据             228.0 MB
|  说明文档.docx              14.7 KB
|  CGGA_mRNA_microarray_C&M.data.included_301.xlsx              103.0 MB
|  CGGA_ALL_mRNAseq_C&M.data.available_325(IDH_updated).xlsx              80.6 MB
|  CGGA_ALL_methylation_27K_C&M.data.included_151.glioma+8.normal.xlsx              44.5 MB
+程序            43.0 KB
  3-关键基因验证.r             15.2 KB
  2-关键基因筛选.r             3.3 KB
  1-数据预处理.r             24.5 KB



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关键词：基因表达 联合分析 Microarray Available Clinical