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翡翠贻贝足丝蛋白的鉴定及其汞、镉抗性和富集行为机制研究
贻贝隶属于软体动物门,是一种常见的海洋双壳贝类,主要生活在有海浪冲击的石礁上。目前,有研究表明贻贝能结合重金属,这可能与贻贝足丝蛋白的极强黏附性能有关。
据推测贻贝足丝蛋白的种类在35种以上,但目前发现的足丝蛋白不多,尚有大量未被鉴定。为了探究贻贝足丝蛋白黏附重金属的机理及分子机制,本文以翡翠贻贝为研究对象,构建翡翠贻贝足丝蛋白的转录组和蛋白组数据库。
通过转录组分析,组装得到73,571个Unigene,其中37.7%的unigene获得功能注释,通过预测编码蛋白框（CDs）共产生34,298个编码序列。结合转录组数据库以及质谱分析,获得了252个足丝蛋白序列,同源比对紫贻贝的足丝蛋白数据库,在足部组织转录组数据库比对到6个足丝蛋白,但在蛋白组数据库只比对到3个蛋白。
挑选了Pvfp6和Antistasin like protein两个足丝蛋白进行分析。Pvfp6半胱氨酸、组氨酸、酪氨酸含量高,推测对重金属有吸附作用,并且Pvfp6具有弹性蛋白酶特异性抑制剂和丝氨酸蛋白酶抑制剂结构域,可保护足丝内其他蛋白免受蛋白酶或者肽酶的降解 ...

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关键词：Protein 半胱氨酸 like 研究对象 数据库