楼主: jingex
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[有偿编程] 用R做个图,急需,500人民币求助 [推广有奖]

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jingex 发表于 2012-7-18 13:26:55 |AI写论文

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是一个生物学数据结果的图,用于文章发表的,数据点比较多,需要用R或者matlab一类的程序生成出来。比较急,希望21号之前就能拿到结果。500元人民币真心求助高手帮忙,应该不是很难。是朋友求助,所以上这边来找熟悉R的朋友帮忙,具体可以和这个QQ联系,号码773666102
下面是具体要求,给建议也行:首先尽量能用脚本画成,因为以后还有更多的类似的图需要画,而且物种会越来越多,如果纯粹手工画会根本难以实现。而且如果合作的好,可以一直持续下去,以后可以考虑以生成的图的数量计费。有数据表:样本(A*,C*,C开头为群体的样本)  类型(SNP,Indel,CNV) 位置(包括染色体单元,每个染色体上的位置) 是否纯和(用0和1表示)   图的基本组成:1. 本图包含以下几个信息,一个是SNP(包括纯和0/0或者1/1,和杂合0/1),然后是Indels(包括纯和0/0或者1/1,和杂合0/1),以及CNV(位置信息)。每一个变异(SNP,Indels和CNV)均包含如下信息(所在的染色体,所在的染色体的位置)2. 本图画的是酵母的样本,包含了单克隆测序样本和群体测序样本(群体测序样本只有SNP和Indels的频率的值,没有是否纯和的问题),单克隆样本为(A7,A8,A9,A10,A11,A12,A14,A15,A16,A17,A18,群体为C1,C2,C3,C4,C5,C6)3. 画图的从上往下的顺序分别为:A15, C5,A7,A8,C1,A11,C6,A9,A10,A18,C2,A16,A12,C3,A17,A14,C4另外还需要一个版本,顺序为(与上个版本为微调,如果是直接脚本生成的话应该无影响)A15, C5,A7,C4,A11,C6,A9,A10,A18,C2,A16,C3,A17,A12,A14,C1要求如下: 首先尽量能用脚本画成,因为以后还有更多的类似的图需要画,而且物种会越来越多,如果纯粹手工画会根本难以实现。而且如果合作的好,可以一直持续下去,以后可以考虑以生成的图的数量计费。有数据表样本(A*,C*,C开头为群体的样本)  类型(SNP,Indel,CNV) 位置(包括染色体单元,每个染色体上的位置) 是否纯和(用0和1表示)   图的基本组成:1. 本图包含以下几个信息,一个是SNP(包括纯和0/0或者1/1,和杂合0/1),然后是Indels(包括纯和0/0或者1/1,和杂合0/1),以及CNV(位置信息)。每一个变异(SNP,Indels和CNV)均包含如下信息(所在的染色体,所在的染色体的位置)2. 本图画的是酵母的样本,包含了单克隆测序样本和群体测序样本(群体测序样本只有SNP和Indels的频率的值,没有是否纯和的问题),单克隆样本为(A7,A8,A9,A10,A11,A12,A14,A15,A16,A17,A18,群体为C1,C2,C3,C4,C5,C6)3. 画图的从上往下的顺序分别为:A15, C5,A7,A8,C1,A11,C6,A9,A10,A18,C2,A16,A12,C3,A17,A14,C4另外还需要一个版本,顺序为(与上个版本为微调,如果是直接脚本生成的话应该无影响)A15, C5,A7,C4,A11,C6,A9,A10,A18,C2,A16,C3,A17,A12,A14,C1要求如下:

example


首先按照染色体的大小进行分段,然后将每个样本的变异位点标上去(SNP, Indels和CNV),其中SNP用三角形,Indels用圆圈,CNV用方块。在A类的样本中,SNP和Indels会出现纯和和杂合的情况,其中纯和SNP用红色的,杂合的用蓝色的(也就是纯和SNP,红色方块,以此类推),CNV用黑色。C样本没有纯和杂合,统一全都用黑色。(三种变异的图形,不是说一定要三角形,圆圈和长方形的,可以换的,只要能表现出来就OK了)最后一步,将那些发生在同一个位点的变异(不同的样本之间),用直线连接起来,如果有发现直线连接到C样本的,在这个变异的上面标记上这个变异在这个样本中的出现频率(在txt文档中包含了),另外,如果有样本是跨样本连接的,比如A1与A7有个变异是相同的,也就是说直接需要跨过C5,这时候跨过的那个样本用虚线,而不用实线,以免产生阅读错误。首先按照染色体的大小进行分段,然后将每个样本的变异位点标上去(SNP, Indels和CNV),其中SNP用三角形,Indels用圆圈,CNV用方块。在A类的样本中,SNP和Indels会出现纯和和杂合的情况,其中纯和SNP用红色的,杂合的用蓝色的(也就是纯和SNP,红色方块,以此类推),CNV用黑色。C样本没有纯和杂合,统一全都用黑色。(三种变异的图形,不是说一定要三角形,圆圈和长方形的,可以换的,只要能表现出来就OK了)最后一步,将那些发生在同一个位点的变异(不同的样本之间),用直线连接起来,如果有发现直线连接到C样本的,在这个变异的上面标记上这个变异在这个样本中的出现频率(在txt文档中包含了),另外,如果有样本是跨样本连接的,比如A1与A7有个变异是相同的,也就是说直接需要跨过C5,这时候跨过的那个样本用虚线,而不用实线,以免产生阅读错误。


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trier2006 发表于 2012-7-21 13:28:43
已经于当日给你发了消息,一直没有回复。
最好的医生是自己,最好的药物是时间……

藤椅
yahoocom 发表于 2012-7-21 16:17:53
呵呵。看来这笔交易已经成交了

板凳
trier2006 发表于 2012-8-1 17:52:57
看来已经不需要人了
最好的医生是自己,最好的药物是时间……

报纸
xingzhaoh 发表于 2012-8-2 09:27:15
程序可以分享一下吗

地板
huominbo888 发表于 2012-8-4 00:01:12
估计没戏了!

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