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尽管“中国科技论文在线”已经度过了最初的稿源困难期，但在一些高水平大学，学者投稿的首选仍是国外期刊，不少人宁愿“耗”上一年半载的时间等待审稿，甚至甘冒被退稿的风险，也不愿将论文首发在国内论文在线平台上。而在国外，这种“先发后审”的在线发表方式也并未得到广泛认可。
症结在哪儿？记者由此展开了调查。
“科技论文在线”上，“真正顶尖的论文，不多”
“什么级别？影响力有多大？评职称管不管用？”刚被问到“愿不愿意在国内在线平台上首发论文”，山西医科大学生理学教授焦向英便抛出了一连串的问题。“虽然我现在不需要评职称了，但还要申报项目、参加教授评级，考核的内容主要是看有多少论文发在国家核心期刊上。如果这个网站被认可的程度很高，我当然愿意发。”
发论文，究竟是为了什么？
这是一个很多学者已经达成“共识”的问题——评职称。但教育部科技发展中心主任李志民却始终觉得“很不对劲”：“20多年前我出国留学的时候，写论文、发论文还没有今天这么功利。一些纸质期刊，还会开辟专门的讨论区，刊登学界对上期论文的讨论争鸣。但现在，论文却丧失了原本的意义，成为评职称、加分的筹码。我们想做的，就是改变已经被异化为评价标准的科研论文，拉近学者间交流的距离，弱化出版角色。”
“还论文学术交流的本来面目”，这既是十年前中国科技论文在线破土而出的重要原因，也是十年来它备受困扰的掣肘所在。原因正如焦向英所说，尽管发文方式简单便捷，但因为看不到能直接体现在工资、职称上的好处，很多优秀论文仍然是“SCI导向”。
“我发论文都是把最好的投在国外期刊上，剩下不好的或是被退稿的，才投在国内期刊上。”北京某重点大学青年教师杨峰告诉记者，这在学术圈是公认的投稿原则，“在一定意义上，在SCI期刊发文代表你的学术成果得到了国际认可，对评职称、学校排名都有好处，有的地方高校甚至会重奖。”
“评价导向和学者观念的共同作用，使得国内优秀论文首发率很低。”李志民感慨。而在这样的“内忧外患”下，尽管在过去10年间，科技论文在线每天发表的论文数量已由最初的每月50篇扩大到目前的每天50篇，但除了专门开辟的“优秀学者库”外，不少人认为，“真正顶尖的论文，还是不多”，学术交流的作用也没有得到很好的体现，“因为发文的、关注的、讨论的都不能代表顶尖水平”。
有事实佐证。记者打开中国科技在线网站，该网站首页推介的“一周热门优秀论文”的前十名，论文作者均为在读研究生，点击量最高有199次，低的只有几十次。在中国数百万科研人员、该网站有32万名注册会员的对照下，这些数字传导的力量显得很微弱。
“很多学校规定研究生毕业必须要发论文，长此以往，这个本意为加强学术交流的网站会不会在缺乏优秀稿源的窘况下，变成研究生论文基地？”有业内人士表示担忧。
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