楼主: moonstone
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[学习分享] COX回归样本量或事后POWER计算方法及可能存在的局限 [推广有奖]

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moonstone 发表于 2016-3-17 20:04:51 |AI写论文

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目前常用的样本量计算软件PASS虽然能够计算COX回归的样本量,但是从下图截图中可以看到其中一个重要参数 R-Squared of X1 with Other X’s是比较难以获得的。
psb.jpg
查询帮助,关于该参数的定义为:
This is the R-Squared that is obtained when X1 is regressed on the other X’s (covariates) in the model.
也即COX模型中其他协变量对X1的决定系数。对于连续性变量而言,该系数还是比较容易计算得到的,但是如果X1为分类变量,X1的决定系数似乎很难理解。查阅该方法的原始文献,分别是以下两篇文章:
Hsieh, F.Y. and Lavori, P.W. 2000. 'Sample-Size Calculations for the Cox Proportional Hazards Regression Model with Nonbinary Covariates', Controlled Clinical Trials, Volume 21, pages 552-560.(下载网址:https://yunpan.cn/cY8GWH5AVvPyb  访问密码 d6f5)
Schoenfeld, David A. 1983. 'Sample-Size Formula for the Proportional-Hazards Regression Model', Biometrics, Volume 39, pages 499-503.(下载网址:https://yunpan.cn/cY8G5WrtjVmnz  访问密码 46e2)

从第一篇文章可以看到,PASS计算的COX回归样本量很可能只适用于协变量为非二分类的连续性变量,相应的方法也见于R(来源:http://artax.karlin.mff.cuni.cz/ ... piCont.default.html)。

但是从R中其他类似的COX回归样本量计算方法中可以看到,似乎该决定系数(R中命名为rho2) 也存在相应的计算方法:
来源:http://artax.karlin.mff.cuni.cz/ ... /html/ssizeEpi.html
ρ=corr(X_1, X_2)=(p_1-p_0)\times√{\frac{q(1-q)}{p(1-p)}},

其中 p=Pr(X_1=1), q=Pr(X_2=1), p_0=Pr(X_1=1|X_2=0), and p_1=Pr(X_1=1 | X_2=1).

上述公式显示似乎并不清楚,查阅原始文献Sample size formula for proportional hazards modelling of competing risks(下载网址:https://yunpan.cn/cYWEXIEPfy23z  访问密码 09c4),公式及说明如下:
psb (1).jpg
但是该公式似乎只对COX模型中存在两个2分类的协变量时有效,对于存在3个及以上的2分类协变量,以及如果同时存在2分类的协变量以及连续性变量时,似乎目前还没有很好的方法。所以大家在采用软件计算COX回归的样本量时应该注意该方法的适用范围,然而软件本身并没有就这点详细说明。
如果大家知道有针对上述局限的样本量计算方法,欢迎交流!

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关键词:Power 计算方法 存在的 Cox 样本量 计算方法

psb (1).jpg (30.32 KB)

psb (1).jpg

沙发
shaobl 发表于 2019-12-18 13:37:16
你好,非常感谢你的探讨。
请问,S (Standard Deviation of X1)这个参数如果X1是二分类变量的话要如何计算呢?

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