楼主: 力哥HL
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[问答] R 的vegan包做cca分析,只有一条排序轴,能调多几个排序轴吗 [推广有奖]

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做CCA分析的时候,遇到只有一个环境因子的数据,结果只有一个CCA轴,平常我都是展示成CCA图,所以只有一个轴的话没办法画平时的图。
翻看了张金屯的《数量生态学》第九章,按照里面的方法排序轴数量好像没有提到限制,试了里面的例子,采用一个环境因子画的是1个CCA轴,两个环境因子画的是2个CCA轴。

问题:
1.R做CCA分析的排序轴数量是否可调?还是说从统计方法上来讲就是不可行?
2.一个环境因子给出一个轴的结果,如果这个结果也是正确的,我改如何解释一条轴上的样方,物种,和环境因子之间的关系?
3.或者是这种一个环境因子的情况有更合适的分析可以做?
跪求各路大神指教,有什么理解错的还请指正

以下是我用张金屯的《数量生态学》的例子数据:
物种\样方

1

2

3

4

5

6

7

1

1

0

0

1

0

2

0

2

0

0

1

0

1

0

1

3

0

2

0

1

0

1

0

4

3

0

0

1

1

0

2

5

1

1

2

0

0

1

0

环境因子中心化后的数据
环境\样方

1

2

3

4

5

6

7

1

-0.03

-0.13

-0.13

0.07

0.37

-0.13

-0.03

2

-0.14

0.26

0.16

-0.24

-0.24

0.16

0.06



以下是我的R结果:
一个环境因子的结果
1个环境因子
两个环境因子的结果
2个环境因子
二维码

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关键词:VEGA 统计方法 生态学 中心化

沙发
CNMAAAA 学生认证  发表于 2019-2-26 14:38:12 |只看作者 |坛友微信交流群
力哥可以请教你一下吗,我画CCA图的时候只有点,没有线
如果方便的话可以加一下我的微信:HQJcomeon或者QQ:2098057993吗

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藤椅
kenanjun@ 发表于 2024-1-8 22:49:07 |只看作者 |坛友微信交流群
我也很想知道只有一个环境变量能不能做cca,能做的话该怎么做呢

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GMT+8, 2024-5-4 18:37