R语言合并多个文件

是 否 +2 论坛币

k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群

赵安豆老师微信：zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

立即领取

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币！

+2 论坛币

现在手里有39个文件，而且挺大，想要将他们合并成一个文件，为了描述清楚过程决定套用一下网上看见的这张图片：

我的数据也是想做一个这样的合并，但是现在完全没有思路，有高手愿意提点一下吗？

扫码加我 拉你入群

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享0 收藏2 回帖

关键词：R语言

多个文件的话，循环 data1=merge(data1,data2,all=T);    即可

我也是初学者，我也来解答下题目。
我先创建了楼主的两个数据框，data1和data2，用于练习。
我用了merge和dplyr包中的full_join两种办法

xing035400 发表于 2018-1-18 14:07
我也是初学者，我也来解答下题目。
我先创建了楼主的两个数据框，data1和data2，用于练习。
我用了merge和 ...

非常感谢！我去试试

xing035400 发表于 2018-1-18 14:07
我也是初学者，我也来解答下题目。
我先创建了楼主的两个数据框，data1和data2，用于练习。
我用了merge和 ...

用这两种方法做出来的结果不一样诶

试了上面那位说的方法，的确是有用的，但是我想批量合并的时候又出错了，本来数据是39个，现在我拿了4个出来测试，代码如下：

1. a = list.files()
   
2. dir = paste("./",a,sep="")
   
3. n = length(dir)
   
4. merge_data = read.csv(file = dir[1],sep=",",header=T)
   
5. for (i in 2:n){
   
6.    new_data = read.csv(file = dir[i],sep=",",header=T)
   
7.    merge_data = merge(merge_data,new_data,by=c("chr","position"),all=TRUE)
   
8. }

复制代码

然后报错了。。。。。。。
Warning message:
In merge.data.frame(merge_data, new_data, by = c("chr", "position"),  :
  column names ‘coverage.x’, ‘methylation.x’, ‘coverage.y’, ‘methylation.y’ are duplicated in the result
我之前试过先手动合并两个，再与第三个合并，列名合并之后是coverage.x、coverage.x.x。。。。。现在说列名重复，那么合并之后的列名可以改吗？以及我的代码有没有问题？请高手告知

不二不幸福 发表于 2018-1-18 20:22
试了上面那位说的方法，的确是有用的，但是我想批量合并的时候又出错了，本来数据是39个，现在我拿了4个出来 ...

就是说我要合并的每个文件和图上一样只有4列，而且这四列的列名都是一样的，所以说我列名重复了

不二不幸福 发表于 2018-1-18 20:22
试了上面那位说的方法，的确是有用的，但是我想批量合并的时候又出错了，本来数据是39个，现在我拿了4个出来 ...

warning不叫报错。
把你的  by=c('chr','position')  去掉

不二不幸福 发表于 2018-1-18 20:40
就是说我要合并的每个文件和图上一样只有4列，而且这四列的列名都是一样的，所以说我列名重复了

尝试着用dplyr包中的full_join，去掉by=c("XXX","XXX")这个参数，如果列名是一致的，那么R会自动帮你匹配

xing035400 发表于 2018-1-19 11:16
尝试着用dplyr包中的full_join，去掉by=c("XXX","XXX")这个参数，如果列名是一致的，那么R会自动帮你匹配

感谢，我试试