第一次发帖，想向论坛里的高人请教个问题。是目前手里的一个咨询的project，关于渔业。想要知道饲料对于同一种鱼体内氨基酸的影响。

有很多很多个水箱，每个水箱里有3条鱼。在实验的1-7天，给所有的鱼喂食一种添加了牛磺酸的饲料。从第8天开始，换回普通的饲料。我们把第8天当做d0，随机抽取3-5个水箱不等，把鱼杀死，测量体内21种氨基酸的含量。每个水箱内3条鱼取平均值，也就是对于每一天，都有3-5个值。在d0, d2, d4, d8, d16天取数据，也就是总共18个。

这个客户想要将氨基酸随时间的变化分类，想确定哪些的变化的pattern是相似的，哪些是特别不一样的。

我的思路是用repeated measure 和factor analysis来做。但问题是，因为每一天的三个数据的方差比较大，如果取平均值来做是否合适？如果不合适，有什么更好的办法？

谢！