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所在主题:
文件名:  完整版R代码.txt
资料下载链接地址: https://bbs.pinggu.org/a-2496919.html
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以下为源代码:

# 读取taxonomy,并添加各列名称
taxonomy = read.delim("rep_seqs_tax.txt", row.names= 1,header=F, sep="\t")
colnames(taxonomy) = c("kingdom","phylum","class","order","family","genus","species","evalue")
# 标记差异OTU类型
x$level = as.factor(ifelse(x$sig==1, "enriched",ifelse(x$sig==-1, "depleted","nosig")))
x$otu = rownames(x)
# 转换Pvalue为负对数
x$neglogp = -log(x$PValue)...


完整版如下:


上面是网络上的源代码,一直想用自己数据试试,但是运行到第二步老是出错。

是没有定义x么?如何解决?求教各位大神,刚刚接触,想学做个曼哈顿图进行生信分析,瞎忙了两天没有点进展根据网络教程所述最后运行成功的图如下:

附上源文件:


真心求教!!!



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