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临床研究论著是指对临床资料进行研讨的论文，是病案资料经整理、回顾、前瞻或追踪性调查和科学分析后写出的学术性文章。其中，正文是研究性论著的核心部分，主要由引言、资料与方法、结果和讨论等部分组成。依据赛恩斯编译的经验来看，临床研究论著在写作上必须以临床实践资料为基础，客观地进行归纳和总结。
一、引言。引言是说明为什么要进行这项研究，立题的依据，拟解决的问题，解决这一问题的目的或意义。好的引言应达到言之有据，起点高，内容新，有值得细读之感。引言切忌冗长和缺乏针对性，应注意引言与摘要的区别。
二、资料与方法。资料与方法是论文的关键部分，目的是交代被考察的对象与特征。临床研究的对象是病人，资料与方法部分主要应说明病例或对照选择的标准与特征、患者的一般资料，分组的方法与样本分配方法，治疗方法，疗效观察指标，疗效标准等。在资料与方法中还应简要说明在什么条件下使用何种统计处理方法、显著性检验，必要时应说明计算手段和软件名称。
三、结果。将调查和观察所得的临床资料进行综合分析，去伪存真，对原始数据分析、归纳并进行统计学处理，就可得出研究结果。但在处理这些原始资料时，应客观、实事求是、随机加以分析，不应有意无意地加以挑选。对于临床研究，各组病例的数目应吻合一致，各种研究结果应注明统计学的差别与意义。在结果中应将图表与文字配合应用，三者内容不应该重复。
结果是研究性论文的核心部分，成功与否取决于结果，结论亦由结果导出。结果部分最能体现论文的学术水平和实用价值，故写作时特别要重视，应做到指标明确可靠，数据准确无误，文字描述简单扼要，图表设计正确合理。不同类型文章结果的内容应有不同的侧重点。例如研究疾病临床经过的论文，应述及是否对研究的病例进行了随访，随访时间与随访率等。对于追踪观察的病例，若失访也应如实交代。
四、讨论。讨论是论文的精华部分，是对引言所提出问题的回答。讨论部分的主要任务是探讨“研究结果”的意义，把研究结果从感性认识提高到理性认识阶段，以供进一步实践的参考。讨论中要以结果为依据，合理分析，找出内在的联系，肯定结果。在讨论中，作者可通过对研究结果的思考、分析和科学推论，从深度和广度两方面丰富和提高对研究结果的认识。
一般而言，讨论水平的高低取决于作者的理论水平、学术素养以及专业知识的深、广度。讨论内容包括：国内外对本课题研究的近况；对结果进行分析讨论，对可能的原因提出见解，并阐明观点；本研究结果的理论或实践意义；论文的创新点，即提出新的见解，并对其理论和实践意义作出评价；本文的限度、缺点、疑点,指出该结果的可能误差等；今后研究的方向、展望、建议、设想和存在的问题。
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