肺癌患者及健康对照人群血液及肠道菌群比较研究

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肺癌患者及健康对照人群血液及肠道菌群比较研究
目的:肺癌是目前中国居民死亡率最高的癌症,吸烟是肺癌最主要的致病因素,此外工业接触、大气污染以及基因突变也是导致肺癌发生的原因。而微生物感染是导致癌症病死率升高的主要原因之一。
近年来,多项研究表明,肠道菌群与肺癌的发生及发展相关。已有研究表明在肺癌患者唾液、支气管肺泡灌洗液及肺癌组织中的菌群与对照组菌群之间存在差异,这种菌群的失调可能促进了肺癌的发展。
本研究旨在比较肺癌患者与健康对照人群血液及肠道菌群的分布差异,为进一步在肺癌治疗的临床应用提供新的选择。方法:本研究收集肺癌患者及健康对照人群的血液及粪便标本,分别提取两组的血液和粪便样本中的DNA,对16S rDNA V1V2区进行PCR扩增,建立文库,采用Illumina测序平台进行测序,应用QIIME软件进行后续分析。
(1)通过绘制OTU稀释曲线来评价样本测序量是否能够反映菌群的绝大部分信息,同时还可以用来比较不同的样本中物种的丰富度;(2)通过Alpha多样性评价一个特定区域或者生态系统内的多样性,即样本内多样性;(3)通过Beta多样性评价样本与样本之间的多样性,以此反映每个样 ...

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关键词：比较研究 Illumina Alpha 基因突变 大气污染