XX抗旱转录组和代谢组联合分析
方案研究背景及目的:
非生物应激反应对动植物适应环境有重要作用,生物只有通过自身应激反应适应环境才能存活。通常情况下,非生物逆境包括如强光、紫外线、高温或低温、冷冻、干旱、盐度、重金属和缺氧等多种复杂的环境条件引起的胁迫。对于植物而言,非生物逆境会引起很多细胞内物质包括核酸、蛋白质、碳水化合物和氨基酸等的积累,表明植物对非生物胁迫的应答机制不是一个线性机制,而是一个涉及多基因、多信号途径、多基因产物和生物化学分子的的复
杂的反应机制。
在系统生物学和功能基因组时代,将多个组学联合运用、从整体上解释生物学问题才是大势所趋。因此,转录组和代谢组
联合分析,
可以从大量转录组信息中发掘差异基因,快速判断核心调控网络和关键候选基因,明确转录因子功能,阐述
生物体响应非生物胁迫应答机制
。转录组(
transcriptome
)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使
RNA、核糖体
RNA、转运RNA及非编码
RNA;狭义上指所有
mRNA
的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的 ...


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