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截至2011年12月，广西医科大学设有73个教研室（组），开设400多门必修课和300多门选修课。拥有国家级双语教学示范课程建设项目1个、省级精品课程20门、省级实验教学示范中心5个、省级教学团队3个。学校现有国家重点（培育）学科1个，国家中医药管理局“十一五”重点专科1个，省级重点学科10个，省部共建教育部重点实验室1个，省级重点实验室5个。学校有基础医学、药学、临床医学3个博士后科研流动站，人体解剖与组织胚胎学、药理学等9个博士点，生物医学工程、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学4个一级学科和39个二级学科硕士点。
广西医科大学学科层次分明，有21个二级学院，10所附属医院（其中非直属附属医院7所），44个教学实习基地。广西医科大学开设有临床医学（含肿瘤学、麻醉学、医学影像学专业方向）、预防医学、口腔医学、药学、护理学、医学检验、信息管理与信息系统、英语、公共事业管理、生物医学工程、社会工作11个本科专业及药学、护理学、口腔医学技术、医学检验技术、康复治疗技术、医疗美容技术6个高职（专科）专业。经国家教育部批准，从2000年开始面向全国招收七年制临床医学专业学生。其中临床医学、预防医学和口腔医学为国家级特色专业建设点。
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