楼主: sln1984sln
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[问答] 怎样画出这样的热力图? [推广有奖]

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沙发
sln1984sln 发表于 2016-7-25 22:45:12 |只看作者 |坛友微信交流群
因为我是小白 所以越详细越好 在网上有类似例子 但是不正确啊

> biocLite("ALL")
错误: 没有"biocLite"这个函数
> library(ALL)
Error in library(ALL) : 不存在叫‘ALL’这个名字的程辑包

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这样乱的图,楼主怎么看

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板凳
曲散人终 发表于 2016-7-26 09:40:42 |只看作者 |坛友微信交流群
看起来这么像microarray数据。。。bioconductor是这样安装的。。。
## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
不过如果是microarray数据的话还是挺麻烦的,R要先读入原始文件,再做处理,然后再做聚类画heatmap。。。我也不是很记得了。。。太久没搞过microarray了。。。

刚才试了一下。。。你好像是想用biocLite("ALL")来安装所有bioconductor的包吧。。。那这个就是microarray数据了?

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sln1984sln 发表于 2016-7-26 21:38:34 |只看作者 |坛友微信交流群
曲散人终 发表于 2016-7-26 09:40
看起来这么像microarray数据。。。bioconductor是这样安装的。。。
## try http:// if https:// URLs are  ...
是基因芯片图 按照网上的不走 报错 不知道是为什么

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地板
曲散人终 发表于 2016-7-27 09:32:56 |只看作者 |坛友微信交流群
sln1984sln 发表于 2016-7-26 21:38
是基因芯片图 按照网上的不走 报错 不知道是为什么
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("ALL")
这样子就可以安装所有的bioconductor软件包了。。。然后再读入数据,再处理,然后再画图。。。

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along6661 发表于 2018-7-14 14:30:28 |只看作者 |坛友微信交流群
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