在SPSS 中利用马氏距离进行聚类分析的方法是：利用全部因子得分进行系统聚类，选择欧式距离。有三种途径可以实现马氏距离聚类。
第一种，从原始数据的相关系数矩阵出发进行因子分析，提取全部因子（m 个），然后利用因子得分进行聚类，选择欧式距离，欧式距离矩阵相当于原始数据的马氏距离矩阵。
第二种，从原始数据的协方差矩阵出发进行因子分析，提取全部因子（m 个），然后利用因子得分进行聚类，选择欧式距离，计算的距离矩阵相当于原始数据的马氏距离矩阵。
第三种，从原始数据的协方差矩阵出发进行因子分析，提取全部因子（m 个）；然后将未经重标的（Raw）因子载荷矩阵转置、求逆，或者求逆、转置；用结果右乘原始数据——
这相当于对原始数据进行“马氏变换”；用这些变换后的数据进行层次聚类，选择欧式距离，可以得到原始数据的马氏距离矩阵。
对于系统聚类分析而言，上述三种方法完全等价。第三种方法相当于常规的马氏距离聚类——利用原始数据计算马氏距离；第二种方法相当于对因子得分进行了一次线性变换（中
心化——通过减去平均值进行平移变换）；第一种方法相当于对原始数据进行了两次线性变换（标准化，即平移变换加伸缩变换，减去平均值后除以标准差），并对结果进行了一次变
换（伸缩变换——除以标准差），利用标准化的数据计算马氏距离。
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