楼主: alasaa
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[问答] 分组语句targets <- data括号里的没看懂 [推广有奖]

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alasaa 发表于 2018-7-30 16:34:40 |AI写论文

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分组语句targets <- data括号里的没看懂, Label = c(paste("Con", 1:4, sep=""), paste("DHT", 1:3, sep="") 这句话,R怎么能辨别 lane1 lane2 lane3 lane4 lane5 lane6 lane8  len这几列,哪个是Con哪个是DHT呢??


谢谢老师解答!
代码如下:


# 1. 载入数据 读取read count数
data <-  read.delim("pnas_expression.txt", row.names=1, stringsAsFactors=FALSE);
head(data);

#输出
# lane1 lane2 lane3 lane4 lane5 lane6 lane8  len
# ENSG00000215696     0     0     0     0     0     0     0  330
# ENSG00000215700     0     0     0     0     0     0     0 2370
# ENSG00000215699     0     0     0     0     0     0     0 1842
# ENSG00000215784     0     0     0     0     0     0     0 2393
# ENSG00000212914     0     0     0     0     0     0     0  384
# ENSG00000212042     0     0     0     0     0     0     0   92

dim(data);
# [1] 37435     8

#2. 构建分组变量
#分为 Control组和DHT组  分别为4个和3个重复
targets <- data.frame(Lane = c(1:6,8), Treatment = c(rep("Control",4),rep("DHT",3)),
                      Label = c(paste("Con", 1:4, sep=""), paste("DHT", 1:3, sep="")));

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陈小瓜的丝瓜 发表于 2018-7-30 22:02:42
targets <- data.frame(······)是创建了一个7行三列的数据框,感觉提供的信息不全面

藤椅
啊啊啊啊啊吖 发表于 2018-7-31 14:22:14
楼主可以再截图多点吗

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