[程序分享] 如何计算p值 [推广有奖]

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NW1 发表于 2018-10-30 17:04:36 |AI写论文

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对于任意一个表达谱中的基因 G:

如果G是集合GL中的基因则他的ES等于该基因的表达水平除以SG

否则记该基因的ES等于 1除以（基因集合BG总个数减去NC）

依次计算每个BG中的基因的ES值，找到其中绝对值最大的ES作为通路A的A.ES

到此通路A的ES计算完毕，我们需要一个统计学方法来评估该ES是否是显著的，即非随机的

我们按照上述计算ES的方法，先随机打乱表达谱中基因的表达顺序，然后再依次计算ES值，如此重复一千次，得到一千个ES值，我们根据这一千个ES值的分布，来计算A.ES在这个分布中所处的位置及出现在该位置时的概率即得到了p值.

我想知道这个P值计算如何用R实现？？？

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[*]10. Calculating p Values [*]How do I get P-values and critical values from R? [*]Manually Calculating P value from t-value in t-test

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