R语言生存分析数据整理

是 否 +2 论坛币

k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群

赵安豆老师微信：zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

立即领取

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币！

+2 论坛币

我想提取两个数据的公共行名（但是它们字符长度不同，只截取前12个字符比较），保留第2个数据后面的基因及表达值，最后再加上第1个数据的生存时间及生存状态列，应该怎么用代码实现呢？求解答，谢谢！

扫码加我 拉你入群

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享0 收藏0 回帖

是不是想通过表2中的‘rn’字段去左连接表1？首先确定是不是一对一的？

drunkfish69 发表于 2020-4-12 10:54
是不是想通过表2中的‘rn’字段去左连接表1？首先确定是不是一对一的？

是想提取两个数据的公共行名。

strivelayo 发表于 2020-4-12 11:19
是想提取两个数据的公共行名。

能不能做两个CSV，把样本数据传上来，这样方便别人帮你。

drunkfish69 发表于 2020-4-12 11:33
能不能做两个CSV，把样本数据传上来，这样方便别人帮你。

小白我不太会这个操作

1.                      mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
   
2. Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
   
3. Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
   
4. Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
   
5. Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
   
6. Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
   
7. Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
   
8. Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
   
9. Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
   
10. Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
    
11. Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
    
12. Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
    
13. Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
    
14. Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
    
15. Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
    
16. Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
    
17. Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
    
18. Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
    
19. Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1

复制代码

你把数据直接copy，贴在帖子里试试。

drunkfish69 发表于 2020-4-12 12:05
你把数据直接copy，贴在帖子里试试。

1        tcga.05.4245        81        0        NA        730        lung        stage iiia        t2        n2        m0        male        2009        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        32        NA        r2        NA        NA
2        tcga.05.4382        68        0        NA        607        lung        stage ib        t2        n0        m0        male        2009        NA        yes        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        62        NA        r0        NA        NA
3        tcga.05.4384        66        0        NA        426        lung        stage iiia        t2        n2        m0        male        2009        NA        yes        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        20        1963        rx        NA        NA
4        tcga.05.4396        76        1        303        NA        lung        stage iiib        t4        n1        m0        male        2006        NA        NA        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        19        1947        r0        NA        NA
5        tcga.05.4402        57        1        244        NA        lung        stage iv        t2        nx        m1        female        2007        NA        no        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        NA        NA        r2        NA        NA
6        tcga.05.4405        74        0        NA        610        lung        stage ib        t2        n0        m0        female        2006        NA        no        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        65        1951        r0        NA        NA
7        tcga.05.4410        62        0        NA        0        lung        stage ib        t2        n0        m0        male        2007        NA        NA        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        98        1958        rx        NA        NA
8        tcga.05.4418        69        1        274        NA        lung        stage iiia        t3        n2        m0        male        2008        NA        NA        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        25        NA        r0        NA        NA
9        tcga.05.4427        65        0        NA        791        lung        stage iib        t2        n1        m0        female        2008        NA        no        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        8        1993        r0        NA        NA
10        tcga.05.4434        67        1        457        NA        lung        stage iv        t4        n1        m1        female        2008        NA        NA        NA        lung adenocarcinoma mixed subtype        15        NA        r2        NA        NA
11        tcga.05.5420        67        0        NA        457        lung        stage iiia        t2        n2        m0        male        2008        NA        NA        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        40        1961        r0        NA        NA
12        tcga.38.4629        68        1        864        NA        lung        stage iib        t3        n0        m0        male        2003        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        100        NA        r0        white        not hispanic or latino
13        tcga.38.4630        75        1        1073        NA        lung        stage ib        t2        n0        m0        female        2000        NA        no        NA        lung papillary adenocarcinoma        NA        NA        r1        white        not hispanic or latino
14        tcga.38.4631        72        1        354        NA        lung        stage ib        t2        n0        m0        female        1997        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        40        NA        r0        white        not hispanic or latino
15        tcga.38.6178        70        0        NA        448        lung        stage iiia        t2b        n2        NA        female        2010        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        NA        NA        r1        white        not hispanic or latino
16        tcga.38.7271        72        1        800        NA        lung        stage ia        t1        n0        m0        female        2006        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        25        1971        r0        white        not hispanic or latino
17        tcga.44.2655        65        0        NA        1324        lung        stage ia        t1        n0        m0        female        2009        575        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        30        1958        r0        white        not hispanic or latino
18        tcga.44.2661        69        0        NA        1159        lung        stage ia        t1        n0        m0        female        2009        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        NA        NA        r0        white        not hispanic or latino
19        tcga.44.2662        65        0        NA        1280        lung        stage ib        t2        n0        m0        male        2009        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not otherwise specified (nos)        56        1956        r0        white        not hispanic or latino

strivelayo 发表于 2020-4-12 13:12
1        tcga.05.4245        81        0        NA        730        lung        stage iiia        t2        n2        m0        male        2009        NA        no        NA        lung adenocarcinoma- not ot ...

我们私信聊吧。

drunkfish69 发表于 2020-4-12 13:24
我们私信聊吧。

我竟然无权发短消息 hhh刚注册的

strivelayo 发表于 2020-4-12 16:50
我竟然无权发短消息 hhh刚注册的

我发短消息给你了，里面有我微信