求助，time-dependent ROC 怎么查最佳临界值？

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time-dependent ROC 怎么查最佳临界值？有没有什么更好的包，survivalROC只能画出图，而没有给出切点值

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关键词：Dependent depend time Pen Tim 求助 临界值 ROC

1# feizhu255

应该可以提取cutoff值的，因为曲线就是根据这些值画的。

List of 6
$ cut.values  : num [1:313] -Inf 4.58 4.9 4.93 4.93 ...
$ TP          : num [1:313] 1 0.999 0.999 0.999 0.998 ...
$ FP          : num [1:313] 1 0.997 0.993 0.99 0.987 ...
$ predict.time: num 365
$ Survival    : num 0.93
$ AUC         : num 0.888
只有出现以上的数据啊，怎么看最佳的cut.values

3# feizhu255

$ cut.values 就是所有备选临界值。

最佳临界值就是使得ROC曲线面积（即$ AUC ）最大对应的临界值。

怎么找AUC对应的最大的cut.value 呢？程序咋写？

5# feizhu255

$AUC不就可以看到所有的AUC么？取最大值呗。

你前面都写出查看cutoff和AUC的方法了，把这2部分组合在一起，自然可以看到二者的对应关系。然后找到最大AUC对应的cutoff

trier2006 发表于 2010-10-21 08:59
3# feizhu255

$ cut.values 就是所有备选临界值。

你好，我想咨询您一个关于ROC曲线的问题，我看您在贴子里回复说：最佳临界值就是使得ROC曲线面积（即$ AUC ）最大对应的临界值，我不太明白，曲线下面积是整条曲线下的面积，怎么可以说某个点的曲线下面积呢？并且某个点怎么可以令曲线下面积最大吗？另外，说约登指数最大处事最佳临界点是不是更合适？
也许我的问题很初级，但是我真的难以理解。等待您的回复.......谢谢

zhoumiaomiao198 发表于 2013-5-9 23:03
你好，我想咨询您一个关于ROC曲线的问题，我看您在贴子里回复说：最佳临界值就是使得ROC曲线面积（即$ AU ...

距离原点最远的点一般来说就是最佳cutoff。同时也可以计算出每个cutoff相应的灵敏度和特异度，根据你的专业需求，选择最佳的灵敏度和特异度对应的cutoff，也可以认为是最佳cutoff。

trier2006 发表于 2013-5-10 07:33
距离原点最远的点一般来说就是最佳cutoff。同时也可以计算出每个cutoff相应的灵敏度和特异度，根据你的专 ...

还是不太明白，距离原点最远的点在曲线上应该是靠近右上角，不是应该左上角的点才最具诊断价值吗？
另外是不是每个点可以对应一个曲线下面积？针对我附件里的图片，是不是可以B点的曲线下面积最大，所以B点是最佳临界点？

zhoumiaomiao198 发表于 2013-5-10 09:17
还是不太明白，距离原点最远的点在曲线上应该是靠近右上角，不是应该左上角的点才最具诊断价值吗？
另 ...

对，b点是最佳临界值。