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各位老师大家晚上好，我是R语言小菜鸡，最近在学习用R语言进行数据分析，在进行以下运算时，最终tested2数据中得到的矫正P值都是相同的数值，请问下面的代码有问题吗？

1. fit<-lmFit(eset,design)
   
2. contrast.matrix<-makeContrasts(EPvsCO = EP-CO,levels = design)
   
3. fit2<-contrasts.fit(fit,contrast.matrix)
   
4. fit2e<-eBayes(fit2)
   
5. 
   
6. tested2<-topTable(fit2e,adjust="fdr",number = Inf,sort.by = "B",coef = 1)

复制代码

希望各位老师不吝赐教~~

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关键词：R语言 Tested 数据分析 test Est

可能是adjust="fdr"把P变一样，试着改这个参数

katymeala 发表于 2021-1-16 09:43
可能是adjust="fdr"把P变一样，试着改这个参数

感谢回答，试过了，最后的结果还是不行~~~