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摘要翻译：
先前的研究表明蛋白质折叠速率与天然态几何结构有很强的相关性，但对这种依赖性的完整解释仍然缺乏。本文用一个简单的统计物理模型研究了速率-几何关系，重点讨论了两类模型几何，分别代表理想的平行结构和反平行结构。我们发现速率的对数与“绝对接触阶”呈近乎完美的线性相关，但斜率取决于所考虑的特定类别。我们根据实验结果讨论了这些发现。
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英文标题：
《Rate Determining Factors in Protein Model Structures》
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作者：
Pierpaolo Bruscolini, Alessandro Pelizzola and Marco Zamparo
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最新提交年份：
2007
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分类信息：
一级分类：Quantitative Biology 数量生物学
二级分类：Biomolecules 生物分子
分类描述：DNA, RNA, proteins, lipids, etc.; molecular structures and folding kinetics; molecular interactions; single-molecule manipulation.
DNA、RNA、蛋白质、脂类等；分子结构与折叠动力学；分子相互作用；单分子操作。
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一级分类：Physics 物理学
二级分类：Statistical Mechanics 统计力学
分类描述：Phase transitions, thermodynamics, field theory, non-equilibrium phenomena, renormalization group and scaling, integrable models, turbulence
相变，热力学，场论，非平衡现象，重整化群和标度，可积模型，湍流
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英文摘要：
Previous research has shown a strong correlation of protein folding rates to the native state geometry, yet a complete explanation for this dependence is still lacking. Here we study the rate-geometry relationship with a simple statistical physics model, and focus on two classes of model geometries, representing ideal parallel and antiparallel structures. We find that the logarithm of the rate shows an almost perfect linear correlation with the "absolute contact order", but the slope depends on the particular class considered. We discuss these findings in the light of experimental results.
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PDF链接：
https://arxiv.org/pdf/709.2243
京公网安备 11010802022788号
