楼主: Auges
2278 0

[程序分享] Error in irlba(A = t(x = object), nv = npcs, ...) : [推广有奖]

  • 0关注
  • 0粉丝

小学生

7%

还不是VIP/贵宾

-

威望
0
论坛币
0 个
通用积分
0
学术水平
0 点
热心指数
0 点
信用等级
0 点
经验
20 点
帖子
1
精华
0
在线时间
7 小时
注册时间
2022-6-25
最后登录
2023-3-31

楼主
Auges 发表于 2022-6-25 10:39:38 |AI写论文

+2 论坛币
k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群
赵安豆老师微信:zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币!

+2 论坛币
第一次发帖,请大大家帮我看看怎么解决这个问题,以下是我具体的代码和数据:
library(Seurat)
library(ggplot2)
library(psych)
data = read.csv('./各个表达矩阵/第1个维数是_59_的表达矩阵.csv',header = T)
rownames(data) = data[,1]
data = data[,-1]
colnames(data) = c(1:dim(data)[2])
cui <- CreateSeuratObject(counts = data)
table(cui@meta.data$orig.ident)
cui <- subset(cui, subset = nFeature_RNA > 0)
dim(cui)
cui <- NormalizeData(cui, normalization.method = "LogNormalize", scale.factor = 10000)
cui <- FindVariableFeatures(cui, selection.method = "vst", nfeatures = 50)
all.genes <- rownames(cui)
cui <- ScaleData(cui, features = all.genes)
cui <- RunPCA(cui,npcs = 10,features = VariableFeatures(object = cui),verbose = FALSE )

出现的错误:Error in irlba(A = t(x = object), nv = npcs, ...) :
  max(nu, nv) must be positive 应该怎么修改呢?
二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

关键词:object Error ect err PCs Seyrat Runpca irlba

您需要登录后才可以回帖 登录 | 我要注册

本版微信群
加好友,备注cda
拉您进交流群
GMT+8, 2026-1-2 23:14