相关性分析
gaom
在我们平时分析的时候,经常会遇到样品间的相关性检验分析,并以此判断对我们后续分析的影响。今天主要跟大家讨论一下简单的相关性分析以及结果展示。
利用的测试数据还是之前我们在geo数据库中随便找的一份表达谱数据。首先还是导入数据,进行简单分析,获取相关数值。
rm(list=
ls())#先把我们的R清空一下
data<-
read.table
(file =
"C:\\Users
\\gaom
\\Desktop
\\R语言绘图
\\相关性分析
\\test_data.txt"
,header =
T,row.names =
1,sep=
"\t")#读取数据
cor(data,
method =
"pearson"
)#方法可选pearson、kendall、spearman。
## T01 T02 T03 T04 T05 T06 T07
## T01 1.0000000 0.9626878 0.9820587 0.9775637 0.9672888 0.9664156 0.9752635
## T02 0.9626878 1.0000000 0.9871793 ...


雷达卡




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