楼主: 石上藤
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关于SNP的SAS关联分析 [推广有奖]

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石上藤 发表于 2012-1-4 11:27:00 |AI写论文

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配合下列模型进行最小二乘方差分析,比较产奶量指标在标记基因型之间的差异。对四个候选基因的分析采用单基因模型,模型如下:

SAS

其中, =产奶量、乳脂率、乳蛋白率、体细胞评分和成年当量(第五胎产奶量估计值)的观测值;

μ= 总体均值;

=场效应;

=-季效应;

=胎次效应;

=各候选基因的基因型效应值;

=随机残差效应。

能不能举个例子 分析下 谢谢

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关键词:关联分析 SNP 最小二乘 方差分析 基因型 基因型 体细胞 模型

沙发
bakoll 发表于 2015-4-10 15:10:16
SAS做SNP关联分析与做其他关联分析基本一致都是基于2x2或者2x3的卡方分析,也可尝试用plink来做

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