大白菜春化种子转录组和DNA甲基化分析

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大白菜春化种子转录组和DNA甲基化分析
开花是植物从营养生长阶段过渡到生殖生长阶段这个蜕变过程的重要标志,春化作用是影响植物开花的主导因素之一。植物春化主要包括两种类型,即绿体感知春化型和种子感知春化型,大白菜是典型的种子春化型蔬菜作物。
本实验以大白菜DH系’FT’种子为试材,设置春化处理组(Ver)与非春化处理组(Nor),利用第二代测序平台(Illumina)分别对以上处理材料的转录组及全基因组DNA甲基化进行深度测序,以期为大白菜种子春化机理的研究提供有益素材。主要研究结果如下:1.通过转录组测序结果可知共得到3379个差异显著的表达基因(FDR≤0.001且|log2Ratio|≥2),其中春化种子中下调基因2363个,上调基因1016个。

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关键词：DNA 大白菜 Illumina ratio ATI