大白菜小孢子早期胚胎发生相关基因的表达分析

是 否 +2 论坛币

k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群

赵安豆老师微信：zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

立即领取

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币！

+2 论坛币

大白菜小孢子早期胚胎发生相关基因的表达分析
植物游离小孢子培养技术在育种工作和基因工程研究中具有重要作用,目前小孢子胚胎发生机理尚未明确,严重限制了该技术的应用。大白菜小孢子培养体系比较成熟,且其基因组测序工作已经完成。
因此,本研究以大白菜为试材,利用转录组测序技术(RNA-Seq)对小孢子胚胎发生早期相关基因的表达情况进行了研究,主要得到了以下结果：1.通过材料筛选,选定一份出胚率较高且能稳定出胚的材料"jihong82"为试材。研究了不同高温处理时间对小孢子出胚率的影响,确定了五份测序样品：TO(未处理的新鲜小孢子),T1-1(高温热激12h的小孢子),T1-2(常温培养12h的小孢子),T2-1(高温热激24h的小孢子)T2-2(常温培养24h的小孢子)。
通过对三种RNA提取方法的比较发现超纯RNA提取试剂盒提取的总RNA质量较高,能够满足转录组测序的要求。2.测序一共得到了141.60M条reads,总碱基数为28.60G。
每个样品的测序总核苷酸数均大于5Gb,Q30比例大于80%,五份样品的测序质量均较高。3.分析了六种可变剪接：ES, IR, AFE, ALE, Al ...

扫码加我 拉你入群

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享0 收藏0 回帖

关键词：大白菜 Reads READ 基因工程 Hong

相关内容：大白菜基因表达分析