利用二级质谱自动进行多糖结构解析的De-novo算法

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利用二级质谱自动进行多糖结构解析的De novo算法
多糖在自然界不仅分布极广泛,而且在生命活动中起着很重要的作用,它可以构成动植物细胞壁的组成成分,如肽聚糖和纤维素；也能以糖原或者淀粉的形式作是动植物体内的储能物质；还有的多糖在特定的生物活动中发挥重要的催化作用,人体许多疾病比如凝血异常、免疫系统失衡、某些神经系统疾病等就和特定多糖息息相关,此外,动物体内蛋白的合成和发挥作用也都离不开多糖。近年来,许多研究者对动植物体内的多糖做了大量分析和研究工作,其中很重要的一个步骤就是确定多糖的结构。
计算机作为一种重要的工具在辅助确定多糖结构时能够有效地解决纯生物化学方法带来的高成本、低效率的问题,并有助于得到更精确的结果。质谱仪是生物信息学中不可缺少的一种测量仪器,它能够利用不同生物大分子质荷比(质量-电荷比)的差异,通过电磁场将它们区分开并将每种大分子的质荷比和在混合物中所占的比重记录在质谱图中。
目前,多糖的结构解析算法主要分为两类,一类在解析的过程中直接使用多糖数据库中的多糖信息,通过将未知多糖的质谱图与已知多糖的谱图进行比对,来确定其结构；另一类在解析的过程中不参照多糖数据库,而是根 ...

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关键词：Novo Nov 神经系统 免疫系统 生物信息