楼主: yaoshunzhe
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[问答] R软件如何读取一个目录下相同后缀的所有文件? [推广有奖]

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yaoshunzhe 发表于 2013-8-17 12:36:55 |AI写论文

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同志们和大大们,我是R的初学者,但是有个project非要用到R来做分析。
然后这里有一段code,目的是读出前80000个lines然后做一个output。
但是每次换一个文件又要改文件名很费事,在这里想请问下R软件如何读取一个目录下相同后缀的所有文件?
谢谢!
perl -ne '$i++; if($i<80001){print}' BM2003_TCCCAGAACAAC_L001_R1_001.fastq > ./
Edited_sequences/ BM2003_TCCCAGAACAAC_L001_R1_001.fastq
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关键词:r软件 Project output Lines outpu 初学者 如何 软件

沙发
assess 发表于 2013-8-22 20:30:20
list.files函数可以,譬如list.files(path='c:/', pattern='fastq$')

藤椅
ryusukekenji 发表于 2013-8-23 02:19:38
assess 发表于 2013-8-22 20:30
list.files函数可以,譬如list.files(path='c:/', pattern='fastq$')
  1. for(i in 1:5) con[[i]] <- odbcConnectAccess(paste("C:/Desktop/Data/source",i,".mdb",sep = ''))
复制代码
可以参考这个吧?

板凳
wooson 发表于 2013-8-23 11:24:09
举个例子,读入d:/temp下所有的dbf文件:
  1. setwd("d:/temp")
  2. filelist = dir(pattern=".dbf")
  3. temp = lapply(filelist, read.dbf)
复制代码


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