替换R的BLAS的方法

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在64位win7下安装OpenBLAS的步骤如下：
1.从压缩文件OpenBLAS-v0.2.8-x86_64-Win.zip中解压libopenblas.dll到R目录下\bin\x64目录中。将此目录中Rblas.dll文件名改成Rblas.dll.back作为备份。将libopenblas.dll文件名改成Rblas.dll。
2.从adda_1.2_win64.zip中解压libgfortran_64-3.dll和libquadmath_64-0.dll文件到R目录下\bin目录中。将libgfortran_64-3.dll文件名改为libgfortran-3.dll即可。

以上是64位win7下的安装过程。如果是32位的win7，请下载http://jaist.dl.sourceforge.net/ ... -v0.2.8-x86-Win.zip，解压替换Rblas.dll即可


安装OpenBLAS之后效果很明显。在自己的机器上试验对比如下：
用R自带的Rblas计算结果：

1. > x <- matrix(rnorm(14761*14761,3,0.2),ncol=14761)
   
2. > gc()
   
3.             used   (Mb) gc trigger   (Mb)  max used   (Mb)
   
4. Ncells    208382   11.2     407500   21.8    350000   18.7
   
5. Vcells 218197628 1664.8  458133964 3495.3 436245544 3328.3
   
6. > system.time(y <- solve(x))
   
7.    user  system elapsed
   
8. 2474.36    5.29 2558.25

复制代码

安装OpenBLAS之后再运算一次

1. > x <- matrix(rnorm(14761*14761,3,0.2),ncol=14761)
   
2. > gc()
   
3.             used   (Mb) gc trigger   (Mb)  max used   (Mb)
   
4. Ncells    185240    9.9     407500   21.8    350000   18.7
   
5. Vcells 218169033 1664.5  458103950 3495.1 436216959 3328.1
   
6. > system.time(y <- solve(x))
   
7.    user  system elapsed
   
8. 351.25    7.24  256.95

复制代码

差距大概有十倍，一个数量级，效率提升很可观。


--------------------------------
需要的两个文件在这里
OpenBLAS-v0.2.8-x86_64-Win.zip (14.27 MB)

2014-1-2 21:39:34 上传

和 adda_1.2_win64.zip (4.3 MB)

2014-1-2 21:39:47 上传

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关键词：Fortran System Source Cells Open 压缩文件

从 julia lang中了解到openBLAS，支持国人http://speed.julialang.org/comparison/

win7 64位R 3.0.2按楼主的方法安装后提示系统中丢失libgfortran-3.dll，请详解

It looks like R is replaced by OpenBLAS when the whole world are studying R language which scared me. Not very long ago, Andew Gelman Announced his Stan is going to replace WinBUGS. Searching online, I found that OpenBLAS is actually One of the software to powers R, which stands for Basic Linear Algebra Subprograms, and felt much better.
For detail, please readhttp://www.r-bloggers.com/an-openblas-based-rblas-for-windows-64/.

Ericabc 发表于 2014-1-3 00:26
win7 64位R 3.0.2按楼主的方法安装后提示系统中丢失libgfortran-3.dll，请详解

2.从adda_1.2_win64.zip中解压libgfortran_64-3.dll和libquadmath_64-0.dll文件到R目录下\bin目录中。将libgfortran_64-3.dll文件名改为libgfortran-3.dll即可

似乎adda_1.2_win64.zip中解压libgfortran_64-3.dll和libquadmath_64-0.dll文件到R目录下\bin中的X64目录中才可以

tiantanshu 发表于 2016-1-4 18:40
似乎adda_1.2_win64.zip中解压libgfortran_64-3.dll和libquadmath_64-0.dll文件到R目录下\bin中的X64目录中 ...

最近两个版本的R的BLAS已经更新。使用了更有效率的软件包。OpenBLAS的新版本不稳定（仅仅个人使用心得，不想代表普遍情形）。我用R自带的BLAS了。

nuomin 发表于 2016-1-6 13:24
最近两个版本的R的BLAS已经更新。使用了更有效率的软件包。OpenBLAS的新版本不稳定（仅仅个人使用心得，不 ...

我试了一下你发的这个版本，似乎效果挺好的，没有遇到什么不稳定的问题。你是指2.15这个版本有问题么？

nuomin 发表于 2014-1-3 08:40
2.从adda_1.2_win64.zip中解压libgfortran_64-3.dll和libquadmath_64-0.dll文件到R目录下\bin目录中。将l ...

已解决