楼主: FLOWER370
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[问答] 如何用R打开cel文件 [推广有奖]

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毛驴东 发表于 2016-4-6 20:52:44
tjbdzr 发表于 2016-2-28 22:29
写了份代码,用于处理大约10GB的cel文件的。参考了楼主的帖子。将目录下的全部cel文件读取并且转成txt,并且 ...
请问你的10-13行是什么意思呢?初学者学习下

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毛驴东 发表于 2016-4-6 21:00:55
tjbdzr 发表于 2016-2-28 22:29
写了份代码,用于处理大约10GB的cel文件的。参考了楼主的帖子。将目录下的全部cel文件读取并且转成txt,并且 ...
这个是将.cel文件原封不动的输出到txt么?

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毛驴东 发表于 2016-4-7 07:35:08
tjbdzr 发表于 2016-2-28 22:29
写了份代码,用于处理大约10GB的cel文件的。参考了楼主的帖子。将目录下的全部cel文件读取并且转成txt,并且 ...
你好这个程序好像有地方不对  输出的txt文件名全部相同

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tjbdzr 学生认证  发表于 2016-4-17 22:20:48
毛驴东 发表于 2016-4-7 07:35
你好这个程序好像有地方不对  输出的txt文件名全部相同
是,有问题存在,后来改了,就是截字符串的问题,就没贴上来,后来这批文件重新处理按mas5计算后直接用于下一步分析了,这块就放过了。你可以试试修改下。

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jiping1023 发表于 2017-9-26 08:34:48
tjbdzr 发表于 2016-2-28 22:29
写了份代码,用于处理大约10GB的cel文件的。参考了楼主的帖子。将目录下的全部cel文件读取并且转成txt,并且 ...
生信我仅接触了不到一个月,您写代码我运行了,这是我第一次完成处理cel文件,谢谢了
但是我是个菜鸟,很多地方不懂,您写的语句的不明白其意思,比如您调用RMA、MAS5对*.cel文件进行标准化处理和background correcting,好像您对数据进行了log转换,到底进行了那些标准化处理和log转换,我不知道。
另外,在处理的最后,报了个错,您看看是什么原因。
Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) :
  invalid 'description' argument

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屋檐滴语 发表于 2017-10-3 13:23:26
tjbdzr 发表于 2016-2-28 22:29
写了份代码,用于处理大约10GB的cel文件的。参考了楼主的帖子。将目录下的全部cel文件读取并且转成txt,并且 ...
直接用lapply函数更简单点。

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qq965670781 发表于 2019-3-30 12:52:40
ReadAff函数读取有个前提,芯片型号是Hgu--133号和95号的。不然读取不了

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