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医药流通企业的转型，无论是并购有增值服务实力的公司还是搭建自己的增值服务平台，都需要大量资本投入。因此，拥有畅通的融资渠道十分重要。
融资是所有企业进行生产经营的前提，同时也是企业发展的必经之路。我国经济体制改革历经30余年，其中资金供应体制和企业组织形式及经营机制的转换初见成效，这使得企业在融资中直接面对的是广阔的金融市场。我国医药流通企业的资金来源也发生了变化，从计划经济时期的全部由国家财政支持慢慢过渡到银行、证券市场和其他金融机构提供其发展所需要的资金。特别是上市公司，其融资渠道的拓展为其融资决策提出了新的挑战。不同融资渠道和融资方式的选择决定着公司的融资数量及质量，进而也决定着公司的生存能力和发展前景。因此，医药流通类上市公司融资渠道的选择成为公司决策的重要内容。
中投顾问发布的《2016-2020年中国医药流通行业投资分析及前景预测报告》指出，上市公司融资渠道主要包括内源融资和外源融资，其中内源融资主要是指企业的自有资金和在生产经营过程中的资金积累部分；外源融资即企业的外部资金来源部分，包括直接融资和间接融资两类。告主要探讨外源融资的渠道，按提供资金的主体不同将融资渠道分成三类：
我国医药流通类上市公司主要还是以债权融资为主，其债务融资结构中短期债务比重较大，长期债务融资比重较小。从负债的期限结构来看，医药流通类上市公司负债以短期负债为主，短期负债占债务总额的比例基本保持在80%左右，而长期负债比重明显偏低，基本在20%左右。与此形成鲜明对比的是，根据Barclay和Smith（1995）的研究，美国公司的负债期限大于一年、两年、三年、四年和五年的负债占总负债的比重分别为73%、65.7%、58.7%、52.2%和45.9%。
中投顾问发布的《2016-2020年中国医药流通行业投资分析及前景预测报告》指出，虽然伴随着我国证券融资方式的发展，直接融资发展一直很快，但进入21世纪后，股权融资在医药流通类上市公司融资总量中仍占较小的比重，以银行信贷为主的间接融资比例占据绝对优势。而在西方发达国家，银行信贷在企业外部融资来源中的比重一般低于70%，而股票和债券等直接融资的比重在20%-30%。
因此，在融资渠道方面，我国医药流通企业可以参考西方发达国家的经验。
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