使用DBSCAN聚类时 out of memory

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有一个距离矩阵 23288 * 23288（是稀疏的, object.size 1824203192 bytes）想通过dbscan的  "dist" method  来聚类  但是报错了

Error in asMethod(object) :
  Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c, line 147  

不知道有什么方法可以处理？
好像可以通过 Matrix的 sprasematrix 转化为稀疏矩阵可以处理，但是没看到能直接转化原有matrix的途径，好像要specifying the locations (row and column) 来转化；
好像也可以通过bigmemory 储存matrix，但是好像使用matrix的时候格式又会有点问题。


好吧 上述只是个人猜测 没用过上述两个包  R怎么处理比较大的数据  没什么经验。
求助~~~~

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关键词：memory scan BSC DBS Out R语言

请问out of memory解决了吗

yuyuhoney 发表于 2019-10-28 23:09
请问out of memory解决了吗

我的报错也是这样的