细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展

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摘要：细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA，主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导，因此，细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类，分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法；其次，将sRNA靶标预测方法分为2类，分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法；最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析，并探讨了进一步的发展方向。

原文链接:http://www.cqvip.com//QK/94144X/200901/29276539.html

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关键词：研究进展 cqvip 预测方法 HTML HTTP SRNA 预测 靶标 细菌