统计每一列字母的个数

是 否 +2 论坛币

k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群

赵安豆老师微信：zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

立即领取

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币！

+2 论坛币

现有数据格式如下： read1_UMI.xlsx (9.46 KB)

2018-4-7 20:20:09 上传

现在想统计每一列中A\T\C\G\N的个数，每一行有12个字母，比如第一列有8个N，A\T\C\G个数为0
请问该怎么做呢？完全没有思路

扫码加我 拉你入群

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享0 收藏0 回帖

关键词：数据格式 怎么做

转成.txt。对每一行进行拆分成字符型。相同字符的加一，最后输出结果就可以了。这个是用面向对象的方法。

不二不幸福 发表于 2018-4-7 20:20
现有数据格式如下：

两种方法，一提取每列字母MID函数，然后筛选计数。二，利用excel数据_分列_固定列宽，将12个字母分成12列，筛选计数，或者直接用计数函数或者if函数

楠楠01271 发表于 2018-4-7 20:35
两种方法，一提取每列字母MID函数，然后筛选计数。二，利用excel数据_分列_固定列宽，将12个字母分成12列 ...

数据很大，很多行，excel根本打不开

LiZara 发表于 2018-4-7 20:29
转成.txt。对每一行进行拆分成字符型。相同字符的加一，最后输出结果就可以了。这个是用面向对象的方法。

怎么拆分啊

嗯，用的Java，编写IO流，读txt文件，把文件内容存到字符串中，然后统计。

LiZara 发表于 2018-4-7 20:39
嗯，用的Java，编写IO流，读txt文件，把文件内容存到字符串中，然后统计。

java不会啊，可不可以用R或者python

用table可以对每一列进行统计，但是，需要先把一个列拆成每个字符一个列，楼上说很大excel根本打不开 ，那就字符串分割的一些函数试试。再table

here you go
import pandas as pd
from collections import Counter

file_p = "z:\\read1_UMI.xlsx"

df = pd.read_excel(file_p, header=None, names=['gen'])
df.gen.apply(lambda x: Counter(list(x)))

and this version is counter for columns
###
import pandas as pd
from collections import Counter

file_p = "z:\\read1_UMI.xlsx"

df0 = pd.read_excel(file_p, header=None, names=['gen'])
vl = df0.gen.values
ff = [list(x) for x in vl]
df = pd.DataFrame(ff)
df.apply(lambda x: Counter(x), axis=0)