【转帖】科研中应该掌握的一些软件——很好很强大

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    刚刚写了一篇文章投了出去，在写作的过程中，走了不少的弯路，真是不写不知道，里面牵涉到的细节问题太多，体会到了科研中工具的重要性，把其中个人用到的一些做个小结，算是抛砖引玉吧，希望对大家能有点帮助，使这些工具能更好的为大家的科研服务，省去不必要浪费的经历，让大家的科研更有乐趣，更有效率。
    文 献 管 理 软 件：EndNote（英文数据库），NoteExpress（中文数据库）；
    功能：海量文献信息的管理、全文管理、笔记管理、自动编排论文或书籍的参考文献、利用杂志全文模版撰写论文、统计与分析。
    文献信息分析软件：RefViz（海量文献信相信大家做科研看的大都是英文论文，因此我向大家推荐的文献管理软件是Endnote。其他如noteexpress等我也用过，不过从个人使用上感觉，后者更适合管理中文文献，而前者在管理英文文献上更胜一筹。毕竟endnote和著名的ISI检索系统（就是SCi）是一家公司的产品，因此其与ISI的联机检索是最好的了。而且现在很多数据库如SD，ACS，Wiley等都与endnote建立了citation的关联，在下载文献的同时可以直接将题目导入到endnote里面，比手工输入方便的多：）
    好了，现在进入正题。工欲善其事，必先利其器。相信这个道理大家都会认同。面对浩如烟海的文献，如果没有一个好的管理工具，相信仅凭个人的记忆来进行分类管理是相当地困难。我看过以前论坛里有人发帖说是按照文献类型进行分类，而后用文件夹管理。说实话，我开始也是用的这个方法，但弊端也很快就出来了。首先是找文献的过程非常麻烦，一层层文件夹点下去头都大了；其次，很难建立一个完善的分类标准，换句话说就是很难判断文献的唯一属性。举个例子，有的人喜欢按照专题分类，有的人喜欢按照实验小组分类，同样研究材料，有人喜欢按照原料分类，有人喜欢按照表征分类，有人喜欢按照反应分类。。。那么，面对多重标准，一篇文献到底应该放在哪个文件夹呢？（千万不要说 CtrlC+V，每个文件夹放一个）。所以，我最后还是把这些麻烦的工作交给了endnote，毕竟电脑比人脑耐心而且不会出错。
    下面说说具体的方法。
    首先是已有文献的管理。如果大家电脑里面已经有了很多pdf论文，那么先请小费点时间到ISI上把这些文献查找出来，然后将这些文献导入到endnote中。就是界面下方的save to Endnote Refman那个按钮。这里建议大家先把选中的文献放到marked list里面最后集中导入（这样快一些），同时导入时别忘了选中导入abstract（具体用途见后文）。等文献都导入到endnote之后，再将每个 pdf文档作为附件放到相应的题录中。对于那些ISI上检索不到的论文（很多学校ISI检索年限有限，像我的学校98年之前都查不到：（），只好靠手工一点一点敲进去了。这里虽然费点事，但可以为以后的阅读和论文写作节约很多时间的。
    而后是文献的检索。还是在ISI上检索，如果学校里面有 SD，ACS等大数据库的也可以在里面检索（不过个人觉得还是在ISI上检索全面一点）。至于要检索哪些论文可以参考一下我以前的帖子，这里不再罗唆了。还是同上面一样，检索后导入endnote，然后有条件下全文的可以下载全文作为附件。

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关键词：很强大 NoteExpress 导入ENDNOTE abstract Endnote 软件 科研

这时，你应该拥有了一个包含很多题录的 endnote的library了。下面要做的就是文献的分类整理。这里面推荐实用endnote XI以后的版本，因为里面增加了一个非常非常实用的功能：group群组管理。就像QQ的群一样，大家可以按照自己的标准建立group（最多可以建50 个，相信对于大多数人应该够用了），而后把文献分门别类的拖入各自的group中。这里的方便之处在于同一个题录可以归属于多个group（在group 下面的题录相当于是链接），这样，就可以建立“双重”乃至“多重”标准对文献分类了。像我就按照研究小组，衬底材料，合成方法等建立了多个group。
    文献分类好了，但如果不经过阅读做笔记，那还是属于电脑的，只有经过个人的消化，才能转化为自己的知识。这时，我的方法是在endnote里进行阅读作笔记。从Endnote里面阅读文献的摘要，初步判断文献的相关度和重要程度。而后在下面note档里面用简短的语言作些描述和评价。然后最好在note前面作上一个表面看过的标记（我是用@符号表示看过,*表示重要，需要阅读全文），因为时间长了很难记住哪些是重点。这里面就涉及到一个文献筛选的问题—— 就是如何通过摘要判断文献的重要性。我觉得这还是很需要个人的实践的，文献读得越多，对文献的理解越深，判断力也会越强。简单的说，就是依靠你课题重点关注的关键词和你实验中出现的问题以及论文写作时discussion中需要解释的现象这三方面来寻找关注的论文。
    当文献都已经做完笔记之后，大致可以判断出哪些可以略读，哪些需要精读了。那么精读那些重点文献吧。我个人建议还是用word做个较为详细的笔记比较好。把文献中经典的句子，重要的数据和讨论记到word里面，有助于日后的论文写作。这时，endnote的作用又可以体现出来了，就是它与word的关联作用。可以将文献作为 reference插入到word里面，免得日后再找文献时不知道引用出处。
    大致先写这么多，以后我再想到什么继续补充进来。希望对大家能有所帮助，觉得好的话就不要吝惜给我几颗星星吧：）
    PS:回答一下一些虫友提的问题，补充一下我现在所知道的一些数据库文献的endnote导入方法
    SD:在检索到文献后的页面上方出现export citation，点击后进入导入页面
    ACS和Wiley：在检索文献后点击abstract进入摘要界面，然后点击Download Citation 进入导入界面
息分析；文献自动分类；给出文献间相互联系； 发现研究前沿和热点；1小时把握10000 篇文献的主旨；），
Quosa（PDF全文信息分析软件；自动下载PDF全文；自动跟踪最新文献）。
    绘图软件：Matlab，Origin，Photoshop，SnagIt（非常好用的一种抓图软件），Visio； 绘图软件的应用中牵涉到很多的细节问题，比如说分辨率的设置、图片的格式、图片当中字号、线型的设置……，需要在实际的应用中加以体会，熟练。
    论文写作与排版工具：Word（所见即所得，既是作者又是编辑还兼打字工；目前不具备参考文献的管理功能，需借助于外部的工具，如NE，EndNote等；随着文件篇幅的增大，处理速度明显减慢）；
    Latex（一种排版的程序语言，高质量的期刊杂志，世界一流的出版社采用的标准投稿文档格式；输出文档格式更加匀称，黑白程度均匀；自带一个辅助程序，轻松的插入各种样式的参考文献；纯文本的文件，稳定性、可扩展性更好）。
    当然这也是一家之言，也希望大家有好的继续补充，呵呵。交流一下，共同进步。

很好啊《谢谢分享

谢谢分享，学习了！

xuexiyixia.

果然很好很强大

学习一下楼主的建议

我现在在用EndNote和NoteExpress。写东西的时候效率相当的高。

好东西，顶楼主！

谢谢，太好了