很多人读过网络皇帝巴拉巴西的《链接》与《爆发》,可能深深地被无尺度网络特性所吸引,不过这位呼声极高的诺奖潜在得主有个克星,来自加州理工的 Lior Pachter 教授。他曾经在博客上连载过三步曲,把网络科学从基础到应用批了个狗血淋头,目测要被巴拉巴西恨一辈子。不过最近他的一篇博文却指出了如何四分钟内写篇论文,相信各位看官应该想到了,靠的就是自动生成的报告。具体来说就是西奈山医学院的一个研究组开发了一个工具biojupies,上传或直接调用已发布的RNA测序数据后自动进行常见的统计分析,是基于 Jupyter Notebook来进行的,还开发了 Chrome 的插件。我估计基于 Rmarkdown 与 Shiny 来实现应该也可以,就是测序数据比较大,不知道后台能否跑得动。这个想法虽然看起来只是功能组合,但这是一个明显的趋势,科研实验自动化后数据分析也会最终自动化,数据分析的技术进步与标准化会使得科研也许不再需要民工做排列组合,那么又需要什么呢?
链接:https://liorpachter.wordpress.com/2018/12/18/how-to-write-a-paper-in-four-minutes/