楼主: 芯踅1
3567 0

[问答] R列线图绘制报错 [推广有奖]

  • 0关注
  • 0粉丝

学前班

80%

还不是VIP/贵宾

-

威望
0
论坛币
0 个
通用积分
0
学术水平
0 点
热心指数
0 点
信用等级
0 点
经验
40 点
帖子
1
精华
0
在线时间
4 小时
注册时间
2020-7-26
最后登录
2021-5-30

楼主
芯踅1 发表于 2020-7-26 11:24:50 |AI写论文

+2 论坛币
k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群
赵安豆老师微信:zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币!

+2 论坛币
画图R报错,求助大佬该怎么解决?
library(rms)
setwd("C:\\immCeRNA\\19.geneNomo")                         #设置工作目录

#TCGA列线图绘制
riskFile="geneRisk.txt"     #风险输入文件
outFile="Nomogram.pdf"      #输出列线图文件名称
risk=read.table(riskFile,header=T,sep="\t",check.names=F,row.names=1)        #读取风险文件
rt=risk[,1:(ncol(risk)-2)]

#数据打包
dd <- datadist(rt)
options(datadist="dd")
#生成函数
f <- cph(Surv(futime, fustat) ~ ., x=T, y=T, surv=T, data=rt, time.inc=1)
surv <- Survival(f)
#建立nomogram
nom <- nomogram(f, fun=list(function(x) surv(1, x), function(x) surv(2, x), function(x) surv(3, x)),
    lp=F, funlabel=c("1-year survival", "2-year survival", "3-year survival"),
    maxscale=100,
    fun.at=c(0.99, 0.9, 0.8, 0.7, 0.5, 0.3,0.1,0.01))  
#nomogram可视化



报错:> #数据打包
> dd <- datadist(rt)
> options(datadist="dd")
> #生成函数
> f <- cph(Surv(futime, fustat) ~ ., x=T, y=T, surv=T, data=rt, time.inc=1)
Error in cph(Surv(futime, fustat) ~ ., x = T, y = T, surv = T, data = rt,  :
  找不到对象'n'
> surv <- Survival(f)
Error in Survival(f) : 找不到对象'f'
> #建立nomogram


二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

关键词:Nomogram Library Names check Table 画图R报错

您需要登录后才可以回帖 登录 | 我要注册

本版微信群
加好友,备注cda
拉您进交流群
GMT+8, 2025-12-29 18:06