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从参考文献的角度对学术论文的创新性进行有效评审，就必须具体分析各条参考文献在论文创新性方面所起的具体作用，并根据参考文献的特征，对参考文献所表述的已有成果与学术论文阐述的新成果进行明确的区分。赛恩斯编译通过对大量学术论文引用的参考文献在其中所起作用进行考察分析，发现各条参考文献在不同论文以及同一篇论文的不同地方被引用时所起的具体作用是不同的。具体可以归纳为以下几类：
一、基于论文选题的参考文献。选题是论文作者在充分了解国内外相关研究现状的基础上，确定的研究命题，对论文的创新性价值起着决定性作用。学术论文选题的基本要求是新颖而有价值，即要研究解决、创立或提出前人没有研究和解决的问题。因此，应该广泛查阅有关文献资料，了解与本课题有关的前人或他人的工作，分析指出存在的问题和不足，从而确定新的论题和研究方向。
当介绍或评论已有相关研究成果并同时提出自己的选题时，往往要引用参考文献，这时参考文献所起的作用就是对论文选题的支撑，并作为论文讨论研究问题的主要依据。因此，基于论文选题的参考文献应该具有一定的创新性。一般来说，近期率高，时效性强表明作者掌握着最新的学术动态，避免了重复性工作，选题具有创新性或前瞻性；文献所涉及的相关专业面和研究领域较宽表明作者的选题具有一定的独创性；该学科或专业发展较先进的国家的外文文献较多表明作者选题视野开阔，整体研究水平起点高。
二、支撑论文论题的参考文献。论文所引用参考文献中的论题、观点、理论或方法等，作为本论文的论证和论述对象，即论题，主要用以指出或说明本论题前人或他人已做的研究工作，而本论文则是对该论题在此基础上做进一步深入的研究，或研究的侧重面及切入角度不同，或研究方法不同，或在论据、论证方面做进一步的补充和完善，或引出新的解释和阐述，或进一步证明其可靠性、正确性，以及发掘其新的学术价值和推广应用价值。
当作为论题的参考文献具有以下特征时，在一定程度上可以说明论文所具有的创新性。一般来说，将最新文献中的有关内容作为论题，展开新的论证，提出新见解或有新发现，则表明不仅研究起点新，而且更加深入；核心期刊或高层次权威性期刊文献对这些文献中的问题所展开研究，表明科研工作的起点高；对经典性问题或理论进行新的拓展研究，往往具有较大的创新价值。
三、基于学术争鸣的参考文献。论文所引用的参考文献中的观点、论断或理论、方法、结果、结论等，作为质疑、争论或反驳的对象。以新的更加充分的论据和更加严密、合理的论证过程，指出或证明前人或他人的观点、论断，或者研究方法、结果、结论等存在的谬误，得出不同的或相反的观点、结果及结论，或者对其进行适当的修正，则在一定程度上说明论文的创新性。
一般来说，对最新文献中的观点、论断、方法、结果或结论等进行持之有据、言之有理的质疑、辩论或反驳，说明作者能把握学科发展的前沿动态，并有自己独到的见解，对促进学术争鸣和学术创新具有重要价值；经典或权威的学术观点、论断或方法乃至理论体系等大多是经过长时间广泛检验的，如果能科学地对它们提出质疑或修正，则具有较大的学术创新意义。
四、支撑论文论据的参考文献。论文所引用参考文献中的观点、论断、实验、观测、理论、公式、方法、实例、数据、图表、计算以及结果、结论等，作为本论文的论据和论述材料，在分析、综合、归纳、演绎、类比、对比或数理推导等论证过程中起论据、阐述或借鉴、参照、对比等作用，以此论证或表明本论文新的观点、理论、方法和研究结果、结论的正确性、可靠性或重要性以及先进性等，则说明本论文的创新性较强。
一般来说，参考文献广泛而全面，表明作者学术功底扎实、学识渊博，为新论点和论断提供的论据较为充分；参考文献近期率高，表明作者摄取科技新信息的能力强，论文的论据新颖，从而能更有力地支持新论点和论断；参考文献学术层次高或具有经典性和权威性，表明能为新论点和论断提供强有力的依据，可靠度较高；参考文献中有适当的自引文献，表明作者对此专题的研究具有一定的深度和新的进展。
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