如何做带百分比且对数处理的ECDF图呀

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求指教 不胜感激 数据是物种多度数据

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关键词：ECDF cdf ECD 百分比 不胜感激 R语言 ；R语言 R语言编程艺术

用你的数据，
计算出1、每一行的物种数百分比，2、群落物种多度百分比，
然后做出每一行的分类（落叶、常绿），
用两列百分比数据做出分组的散点图，然后添加两组散点图的拟合线即可。
主要问题是，你用那种方法计算物种多度。

llb_321 发表于 2021-3-27 15:19
用你的数据，
计算出1、每一行的物种数百分比，2、群落物种多度百分比，
然后做出每一行的分类（落叶、常 ...

是要先算数百分比吗？我以为用ggplot2作图，ggplot(data=df,aes(x=x)+stat_ecdf（）
得到x轴是物种多度等级 y轴是百分比

llb_321 发表于 2021-3-27 15:19
用你的数据，
计算出1、每一行的物种数百分比，2、群落物种多度百分比，
然后做出每一行的分类（落叶、常 ...

我好像明白一点点了？可以随机抽样 然后用对数拟合这样吗？

wye1108 发表于 2021-3-27 16:39
我好像明白一点点了？可以随机抽样 然后用对数拟合这样吗？

抱歉啊，我之前说的是另外一种方法。
后来你说的这个ecdf是可以做出楼顶的图的，但是需要你把原来的数据加一列分组，比如常绿为1，落叶为2，这样在作图时，aes中加上分组就可以画出两条线了。你写的代码里改一下aes(x,group=g)，g是示例数据中的分组依据。

你那个示例代码如果要画出点，可以这样
ggplot(df, aes(x,group=g,color=g)) + stat_ecdf(geom = "point",size=2)

ggplot做出的已经是累积分布线，不需要另外拟合。
楼顶的图应该是用其他的环境实现的。

llb_321 发表于 2021-3-27 17:17
你那个示例代码如果要画出点，可以这样
ggplot(df, aes(x,group=g,color=g)) + stat_ecdf(geom = "point ...

做出的图只有三个点哎 而且x轴也不是百分数

做出来是这样的

llb_321 发表于 2021-3-27 17:20
ggplot做出的已经是累积分布线，不需要另外拟合。
楼顶的图应该是用其他的环境实现的。

可以通过随机抽样做出散点图加拟合线嘛 好家伙 已经晕了